Protein–RNA interactions for Protein: Q99PU5

Acsbg1, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase ACSBG1, mousemouse

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsbg1Q99PU5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Acsbg1Q99PU5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Acsbg1Q99PU5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Acsbg1Q99PU5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Acsbg1Q99PU5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Acsbg1Q99PU5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Acsbg1Q99PU5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Acsbg1Q99PU5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Acsbg1Q99PU5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Acsbg1Q99PU5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Acsbg1Q99PU5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Acsbg1Q99PU5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Acsbg1Q99PU5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Acsbg1Q99PU5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Acsbg1Q99PU5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Acsbg1Q99PU5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Acsbg1Q99PU5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Acsbg1Q99PU5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Acsbg1Q99PU5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Acsbg1Q99PU5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Acsbg1Q99PU5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Acsbg1Q99PU5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Acsbg1Q99PU5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Acsbg1Q99PU5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Acsbg1Q99PU5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Acsbg1Q99PU5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
Acsbg1Q99PU5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
Acsbg1Q99PU5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Acsbg1Q99PU5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Acsbg1Q99PU5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Acsbg1Q99PU5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Acsbg1Q99PU5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Acsbg1Q99PU5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Acsbg1Q99PU5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Acsbg1Q99PU5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Acsbg1Q99PU5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
Acsbg1Q99PU5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Acsbg1Q99PU5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Acsbg1Q99PU5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Acsbg1Q99PU5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Acsbg1Q99PU5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Acsbg1Q99PU5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Acsbg1Q99PU5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
Acsbg1Q99PU5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Acsbg1Q99PU5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Acsbg1Q99PU5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Acsbg1Q99PU5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Acsbg1Q99PU5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Acsbg1Q99PU5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Acsbg1Q99PU5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Acsbg1Q99PU5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Acsbg1Q99PU5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Acsbg1Q99PU5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Acsbg1Q99PU5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Acsbg1Q99PU5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Acsbg1Q99PU5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Acsbg1Q99PU5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Acsbg1Q99PU5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Acsbg1Q99PU5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Acsbg1Q99PU5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Acsbg1Q99PU5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Acsbg1Q99PU5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Acsbg1Q99PU5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Acsbg1Q99PU5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Acsbg1Q99PU5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Acsbg1Q99PU5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Acsbg1Q99PU5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Acsbg1Q99PU5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Acsbg1Q99PU5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Acsbg1Q99PU5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Acsbg1Q99PU5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Acsbg1Q99PU5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Acsbg1Q99PU5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Acsbg1Q99PU5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Acsbg1Q99PU5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Acsbg1Q99PU5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Acsbg1Q99PU5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
Acsbg1Q99PU5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
Acsbg1Q99PU5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Acsbg1Q99PU5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
Acsbg1Q99PU5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
Acsbg1Q99PU5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Acsbg1Q99PU5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
Acsbg1Q99PU5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Acsbg1Q99PU5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Acsbg1Q99PU5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Acsbg1Q99PU5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Acsbg1Q99PU5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Acsbg1Q99PU5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Acsbg1Q99PU5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Acsbg1Q99PU5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Acsbg1Q99PU5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Acsbg1Q99PU5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Acsbg1Q99PU5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Acsbg1Q99PU5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Acsbg1Q99PU5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Acsbg1Q99PU5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Acsbg1Q99PU5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Acsbg1Q99PU5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Acsbg1Q99PU5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms