Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.77
Rrbp1Q99PL5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Rrbp1Q99PL5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
Rrbp1Q99PL5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Rrbp1Q99PL5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Rrbp1Q99PL5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
Rrbp1Q99PL5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Rrbp1Q99PL5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
Rrbp1Q99PL5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
Rrbp1Q99PL5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC38.51■■■■□ 3.75
Rrbp1Q99PL5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC38.49■■■■□ 3.75
Rrbp1Q99PL5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Rrbp1Q99PL5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC38.47■■■■□ 3.75
Rrbp1Q99PL5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Rrbp1Q99PL5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Rrbp1Q99PL5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
Rrbp1Q99PL5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Rrbp1Q99PL5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
Rrbp1Q99PL5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Rrbp1Q99PL5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC38.4■■■■□ 3.74
Rrbp1Q99PL5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Rrbp1Q99PL5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Rrbp1Q99PL5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Rrbp1Q99PL5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
Rrbp1Q99PL5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
Rrbp1Q99PL5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Rrbp1Q99PL5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
Rrbp1Q99PL5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Rrbp1Q99PL5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Rrbp1Q99PL5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Rrbp1Q99PL5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Rrbp1Q99PL5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Rrbp1Q99PL5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC38.26■■■■□ 3.71
Rrbp1Q99PL5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Rrbp1Q99PL5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC38.23■■■■□ 3.71
Rrbp1Q99PL5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Rrbp1Q99PL5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
Rrbp1Q99PL5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Rrbp1Q99PL5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Rrbp1Q99PL5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Rrbp1Q99PL5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC38.21■■■■□ 3.71
Rrbp1Q99PL5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC38.21■■■■□ 3.71
Rrbp1Q99PL5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC38.2■■■■□ 3.7
Rrbp1Q99PL5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.7
Rrbp1Q99PL5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Rrbp1Q99PL5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Rrbp1Q99PL5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
Rrbp1Q99PL5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC38.18■■■■□ 3.7
Rrbp1Q99PL5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Rrbp1Q99PL5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
Rrbp1Q99PL5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Rrbp1Q99PL5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Rrbp1Q99PL5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Rrbp1Q99PL5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
Rrbp1Q99PL5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC38.15■■■■□ 3.7
Rrbp1Q99PL5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Rrbp1Q99PL5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Rrbp1Q99PL5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Rrbp1Q99PL5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Rrbp1Q99PL5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
Rrbp1Q99PL5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Rrbp1Q99PL5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Rrbp1Q99PL5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
Rrbp1Q99PL5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Rrbp1Q99PL5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Rrbp1Q99PL5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Rrbp1Q99PL5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Rrbp1Q99PL5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
Rrbp1Q99PL5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC38.07■■■■□ 3.68
Rrbp1Q99PL5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
Rrbp1Q99PL5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Rrbp1Q99PL5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Rrbp1Q99PL5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Rrbp1Q99PL5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Rrbp1Q99PL5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Rrbp1Q99PL5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Rrbp1Q99PL5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Rrbp1Q99PL5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
Rrbp1Q99PL5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.68
Rrbp1Q99PL5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Rrbp1Q99PL5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
Rrbp1Q99PL5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Rrbp1Q99PL5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Rrbp1Q99PL5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Rrbp1Q99PL5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC37.98■■■■□ 3.67
Rrbp1Q99PL5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC37.96■■■■□ 3.67
Rrbp1Q99PL5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
Rrbp1Q99PL5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Rrbp1Q99PL5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Rrbp1Q99PL5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
Rrbp1Q99PL5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Rrbp1Q99PL5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Rrbp1Q99PL5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Rrbp1Q99PL5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Rrbp1Q99PL5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Rrbp1Q99PL5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Rrbp1Q99PL5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
Rrbp1Q99PL5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
Rrbp1Q99PL5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
Rrbp1Q99PL5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms