Protein–RNA interactions for Protein: Q99M87

Dnaja3, DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaja3Q99M87 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnaja3Q99M87 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnaja3Q99M87 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnaja3Q99M87 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnaja3Q99M87 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnaja3Q99M87 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnaja3Q99M87 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnaja3Q99M87 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnaja3Q99M87 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnaja3Q99M87 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnaja3Q99M87 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnaja3Q99M87 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dnaja3Q99M87 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dnaja3Q99M87 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dnaja3Q99M87 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dnaja3Q99M87 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dnaja3Q99M87 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dnaja3Q99M87 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dnaja3Q99M87 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dnaja3Q99M87 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dnaja3Q99M87 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dnaja3Q99M87 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dnaja3Q99M87 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dnaja3Q99M87 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dnaja3Q99M87 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dnaja3Q99M87 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dnaja3Q99M87 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dnaja3Q99M87 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dnaja3Q99M87 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dnaja3Q99M87 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dnaja3Q99M87 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Dnaja3Q99M87 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Dnaja3Q99M87 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dnaja3Q99M87 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dnaja3Q99M87 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dnaja3Q99M87 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dnaja3Q99M87 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dnaja3Q99M87 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dnaja3Q99M87 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dnaja3Q99M87 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dnaja3Q99M87 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dnaja3Q99M87 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dnaja3Q99M87 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dnaja3Q99M87 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dnaja3Q99M87 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Dnaja3Q99M87 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Dnaja3Q99M87 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Dnaja3Q99M87 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dnaja3Q99M87 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dnaja3Q99M87 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dnaja3Q99M87 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dnaja3Q99M87 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dnaja3Q99M87 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dnaja3Q99M87 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dnaja3Q99M87 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dnaja3Q99M87 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dnaja3Q99M87 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dnaja3Q99M87 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dnaja3Q99M87 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Dnaja3Q99M87 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dnaja3Q99M87 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dnaja3Q99M87 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dnaja3Q99M87 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dnaja3Q99M87 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dnaja3Q99M87 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dnaja3Q99M87 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dnaja3Q99M87 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dnaja3Q99M87 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Dnaja3Q99M87 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Dnaja3Q99M87 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dnaja3Q99M87 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dnaja3Q99M87 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dnaja3Q99M87 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dnaja3Q99M87 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dnaja3Q99M87 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dnaja3Q99M87 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dnaja3Q99M87 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dnaja3Q99M87 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dnaja3Q99M87 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dnaja3Q99M87 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dnaja3Q99M87 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dnaja3Q99M87 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dnaja3Q99M87 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dnaja3Q99M87 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dnaja3Q99M87 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dnaja3Q99M87 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dnaja3Q99M87 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dnaja3Q99M87 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dnaja3Q99M87 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dnaja3Q99M87 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dnaja3Q99M87 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dnaja3Q99M87 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dnaja3Q99M87 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Dnaja3Q99M87 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dnaja3Q99M87 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dnaja3Q99M87 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dnaja3Q99M87 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dnaja3Q99M87 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dnaja3Q99M87 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dnaja3Q99M87 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms