Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ0

Cttnbp2nl, CTTNBP2 N-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2nlQ99LJ0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cttnbp2nlQ99LJ0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cttnbp2nlQ99LJ0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cttnbp2nlQ99LJ0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cttnbp2nlQ99LJ0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cttnbp2nlQ99LJ0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cttnbp2nlQ99LJ0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cttnbp2nlQ99LJ0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cttnbp2nlQ99LJ0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cttnbp2nlQ99LJ0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cttnbp2nlQ99LJ0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cttnbp2nlQ99LJ0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cttnbp2nlQ99LJ0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Cttnbp2nlQ99LJ0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cttnbp2nlQ99LJ0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cttnbp2nlQ99LJ0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cttnbp2nlQ99LJ0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cttnbp2nlQ99LJ0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cttnbp2nlQ99LJ0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cttnbp2nlQ99LJ0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cttnbp2nlQ99LJ0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cttnbp2nlQ99LJ0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cttnbp2nlQ99LJ0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Cttnbp2nlQ99LJ0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cttnbp2nlQ99LJ0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cttnbp2nlQ99LJ0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cttnbp2nlQ99LJ0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cttnbp2nlQ99LJ0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms