Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN9

Clint1, Clathrin interactor 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clint1Q99KN9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Clint1Q99KN9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Clint1Q99KN9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clint1Q99KN9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clint1Q99KN9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clint1Q99KN9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clint1Q99KN9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clint1Q99KN9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clint1Q99KN9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Clint1Q99KN9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clint1Q99KN9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clint1Q99KN9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clint1Q99KN9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clint1Q99KN9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clint1Q99KN9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clint1Q99KN9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clint1Q99KN9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clint1Q99KN9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clint1Q99KN9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clint1Q99KN9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clint1Q99KN9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clint1Q99KN9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clint1Q99KN9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clint1Q99KN9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clint1Q99KN9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clint1Q99KN9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Clint1Q99KN9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clint1Q99KN9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clint1Q99KN9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clint1Q99KN9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clint1Q99KN9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clint1Q99KN9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Clint1Q99KN9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clint1Q99KN9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clint1Q99KN9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clint1Q99KN9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clint1Q99KN9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clint1Q99KN9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clint1Q99KN9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clint1Q99KN9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clint1Q99KN9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clint1Q99KN9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clint1Q99KN9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clint1Q99KN9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Clint1Q99KN9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clint1Q99KN9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clint1Q99KN9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clint1Q99KN9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clint1Q99KN9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clint1Q99KN9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clint1Q99KN9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clint1Q99KN9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clint1Q99KN9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clint1Q99KN9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clint1Q99KN9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Clint1Q99KN9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clint1Q99KN9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clint1Q99KN9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clint1Q99KN9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clint1Q99KN9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Clint1Q99KN9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Clint1Q99KN9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Clint1Q99KN9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clint1Q99KN9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Clint1Q99KN9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clint1Q99KN9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clint1Q99KN9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clint1Q99KN9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clint1Q99KN9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clint1Q99KN9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clint1Q99KN9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clint1Q99KN9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clint1Q99KN9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clint1Q99KN9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clint1Q99KN9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clint1Q99KN9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clint1Q99KN9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Clint1Q99KN9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Clint1Q99KN9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Clint1Q99KN9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Clint1Q99KN9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Clint1Q99KN9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Clint1Q99KN9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clint1Q99KN9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clint1Q99KN9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clint1Q99KN9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clint1Q99KN9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clint1Q99KN9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clint1Q99KN9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clint1Q99KN9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clint1Q99KN9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clint1Q99KN9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clint1Q99KN9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clint1Q99KN9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clint1Q99KN9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clint1Q99KN9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clint1Q99KN9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clint1Q99KN9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clint1Q99KN9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clint1Q99KN9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms