Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp11Q99K46 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp11Q99K46 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp11Q99K46 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp11Q99K46 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp11Q99K46 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp11Q99K46 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp11Q99K46 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp11Q99K46 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp11Q99K46 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp11Q99K46 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp11Q99K46 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp11Q99K46 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp11Q99K46 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp11Q99K46 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp11Q99K46 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp11Q99K46 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp11Q99K46 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp11Q99K46 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp11Q99K46 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp11Q99K46 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp11Q99K46 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp11Q99K46 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp11Q99K46 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp11Q99K46 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp11Q99K46 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp11Q99K46 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp11Q99K46 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp11Q99K46 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp11Q99K46 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp11Q99K46 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Usp11Q99K46 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Usp11Q99K46 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Usp11Q99K46 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Usp11Q99K46 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp11Q99K46 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp11Q99K46 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp11Q99K46 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp11Q99K46 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp11Q99K46 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp11Q99K46 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp11Q99K46 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp11Q99K46 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp11Q99K46 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp11Q99K46 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp11Q99K46 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp11Q99K46 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp11Q99K46 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp11Q99K46 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp11Q99K46 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp11Q99K46 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp11Q99K46 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp11Q99K46 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp11Q99K46 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp11Q99K46 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp11Q99K46 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp11Q99K46 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp11Q99K46 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp11Q99K46 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp11Q99K46 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp11Q99K46 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp11Q99K46 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp11Q99K46 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp11Q99K46 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp11Q99K46 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp11Q99K46 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp11Q99K46 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp11Q99K46 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp11Q99K46 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp11Q99K46 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp11Q99K46 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp11Q99K46 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp11Q99K46 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp11Q99K46 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp11Q99K46 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp11Q99K46 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp11Q99K46 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp11Q99K46 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp11Q99K46 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp11Q99K46 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp11Q99K46 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp11Q99K46 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp11Q99K46 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp11Q99K46 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp11Q99K46 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp11Q99K46 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp11Q99K46 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp11Q99K46 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp11Q99K46 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp11Q99K46 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp11Q99K46 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp11Q99K46 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp11Q99K46 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp11Q99K46 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp11Q99K46 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp11Q99K46 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp11Q99K46 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp11Q99K46 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp11Q99K46 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp11Q99K46 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms