Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf144aQ925F3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf144aQ925F3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf144aQ925F3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf144aQ925F3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf144aQ925F3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf144aQ925F3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf144aQ925F3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf144aQ925F3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf144aQ925F3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf144aQ925F3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf144aQ925F3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf144aQ925F3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf144aQ925F3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf144aQ925F3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf144aQ925F3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf144aQ925F3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf144aQ925F3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf144aQ925F3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf144aQ925F3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rnf144aQ925F3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf144aQ925F3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf144aQ925F3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf144aQ925F3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf144aQ925F3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf144aQ925F3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf144aQ925F3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf144aQ925F3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf144aQ925F3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf144aQ925F3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnf144aQ925F3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnf144aQ925F3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnf144aQ925F3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rnf144aQ925F3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf144aQ925F3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf144aQ925F3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf144aQ925F3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf144aQ925F3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf144aQ925F3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf144aQ925F3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf144aQ925F3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf144aQ925F3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf144aQ925F3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf144aQ925F3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf144aQ925F3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rnf144aQ925F3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rnf144aQ925F3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rnf144aQ925F3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnf144aQ925F3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnf144aQ925F3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnf144aQ925F3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnf144aQ925F3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnf144aQ925F3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnf144aQ925F3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf144aQ925F3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf144aQ925F3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf144aQ925F3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rnf144aQ925F3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rnf144aQ925F3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Rnf144aQ925F3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf144aQ925F3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf144aQ925F3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf144aQ925F3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf144aQ925F3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf144aQ925F3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf144aQ925F3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf144aQ925F3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf144aQ925F3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf144aQ925F3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf144aQ925F3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf144aQ925F3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnf144aQ925F3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf144aQ925F3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf144aQ925F3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf144aQ925F3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf144aQ925F3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf144aQ925F3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf144aQ925F3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf144aQ925F3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf144aQ925F3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf144aQ925F3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf144aQ925F3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf144aQ925F3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf144aQ925F3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf144aQ925F3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf144aQ925F3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf144aQ925F3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rnf144aQ925F3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rnf144aQ925F3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf144aQ925F3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf144aQ925F3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf144aQ925F3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf144aQ925F3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf144aQ925F3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf144aQ925F3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf144aQ925F3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf144aQ925F3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf144aQ925F3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnf144aQ925F3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnf144aQ925F3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms