Protein–RNA interactions for Protein: Q924W9

Lmo1, Rhombotin-1, mousemouse

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo1Q924W9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmo1Q924W9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmo1Q924W9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmo1Q924W9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmo1Q924W9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmo1Q924W9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmo1Q924W9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmo1Q924W9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmo1Q924W9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmo1Q924W9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmo1Q924W9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmo1Q924W9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmo1Q924W9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmo1Q924W9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmo1Q924W9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmo1Q924W9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmo1Q924W9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmo1Q924W9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmo1Q924W9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmo1Q924W9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmo1Q924W9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmo1Q924W9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmo1Q924W9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmo1Q924W9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmo1Q924W9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmo1Q924W9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmo1Q924W9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmo1Q924W9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmo1Q924W9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmo1Q924W9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmo1Q924W9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmo1Q924W9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmo1Q924W9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmo1Q924W9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmo1Q924W9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmo1Q924W9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmo1Q924W9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmo1Q924W9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmo1Q924W9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmo1Q924W9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmo1Q924W9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmo1Q924W9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmo1Q924W9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmo1Q924W9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmo1Q924W9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmo1Q924W9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmo1Q924W9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmo1Q924W9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmo1Q924W9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmo1Q924W9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmo1Q924W9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmo1Q924W9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmo1Q924W9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lmo1Q924W9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Lmo1Q924W9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmo1Q924W9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmo1Q924W9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmo1Q924W9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmo1Q924W9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmo1Q924W9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmo1Q924W9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lmo1Q924W9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmo1Q924W9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmo1Q924W9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmo1Q924W9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmo1Q924W9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmo1Q924W9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmo1Q924W9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmo1Q924W9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmo1Q924W9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmo1Q924W9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmo1Q924W9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmo1Q924W9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmo1Q924W9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmo1Q924W9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmo1Q924W9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmo1Q924W9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmo1Q924W9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmo1Q924W9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmo1Q924W9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmo1Q924W9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmo1Q924W9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmo1Q924W9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmo1Q924W9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmo1Q924W9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmo1Q924W9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmo1Q924W9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmo1Q924W9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmo1Q924W9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmo1Q924W9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmo1Q924W9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmo1Q924W9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmo1Q924W9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmo1Q924W9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmo1Q924W9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmo1Q924W9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmo1Q924W9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmo1Q924W9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmo1Q924W9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lmo1Q924W9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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