Protein–RNA interactions for Protein: Q921D9

Grhl1, Grainyhead-like protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grhl1Q921D9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Grhl1Q921D9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Grhl1Q921D9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Grhl1Q921D9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Grhl1Q921D9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Grhl1Q921D9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Grhl1Q921D9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Grhl1Q921D9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Grhl1Q921D9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Grhl1Q921D9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Grhl1Q921D9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Grhl1Q921D9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Grhl1Q921D9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Grhl1Q921D9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Grhl1Q921D9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Grhl1Q921D9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Grhl1Q921D9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Grhl1Q921D9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Grhl1Q921D9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Grhl1Q921D9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Grhl1Q921D9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Grhl1Q921D9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Grhl1Q921D9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Grhl1Q921D9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Grhl1Q921D9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Grhl1Q921D9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Grhl1Q921D9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Grhl1Q921D9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Grhl1Q921D9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Grhl1Q921D9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Grhl1Q921D9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Grhl1Q921D9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Grhl1Q921D9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Grhl1Q921D9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Grhl1Q921D9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Grhl1Q921D9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Grhl1Q921D9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Grhl1Q921D9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Grhl1Q921D9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Grhl1Q921D9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Grhl1Q921D9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Grhl1Q921D9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Grhl1Q921D9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Grhl1Q921D9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Grhl1Q921D9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Grhl1Q921D9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Grhl1Q921D9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Grhl1Q921D9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Grhl1Q921D9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Grhl1Q921D9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Grhl1Q921D9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Grhl1Q921D9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Grhl1Q921D9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Grhl1Q921D9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Grhl1Q921D9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Grhl1Q921D9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Grhl1Q921D9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Grhl1Q921D9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Grhl1Q921D9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Grhl1Q921D9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Grhl1Q921D9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Grhl1Q921D9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Grhl1Q921D9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Grhl1Q921D9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Grhl1Q921D9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Grhl1Q921D9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Grhl1Q921D9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Grhl1Q921D9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Grhl1Q921D9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Grhl1Q921D9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Grhl1Q921D9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Grhl1Q921D9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Grhl1Q921D9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Grhl1Q921D9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Grhl1Q921D9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Grhl1Q921D9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Grhl1Q921D9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Grhl1Q921D9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Grhl1Q921D9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Grhl1Q921D9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Grhl1Q921D9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Grhl1Q921D9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Grhl1Q921D9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Grhl1Q921D9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Grhl1Q921D9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Grhl1Q921D9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Grhl1Q921D9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Grhl1Q921D9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Grhl1Q921D9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Grhl1Q921D9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Grhl1Q921D9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Grhl1Q921D9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Grhl1Q921D9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Grhl1Q921D9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Grhl1Q921D9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Grhl1Q921D9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Grhl1Q921D9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Grhl1Q921D9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Grhl1Q921D9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Grhl1Q921D9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 159.3 ms