Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Med28Q920D3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Med28Q920D3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Med28Q920D3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Med28Q920D3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Med28Q920D3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Med28Q920D3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Med28Q920D3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Med28Q920D3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Med28Q920D3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Med28Q920D3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Med28Q920D3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Med28Q920D3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Med28Q920D3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Med28Q920D3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Med28Q920D3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Med28Q920D3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Med28Q920D3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Med28Q920D3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Med28Q920D3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Med28Q920D3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Med28Q920D3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Med28Q920D3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Med28Q920D3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Med28Q920D3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Med28Q920D3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Med28Q920D3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Med28Q920D3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Med28Q920D3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Med28Q920D3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Med28Q920D3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Med28Q920D3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Med28Q920D3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Med28Q920D3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Med28Q920D3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Med28Q920D3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Med28Q920D3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Med28Q920D3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Med28Q920D3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Med28Q920D3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Med28Q920D3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med28Q920D3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med28Q920D3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med28Q920D3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Med28Q920D3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Med28Q920D3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Med28Q920D3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Med28Q920D3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Med28Q920D3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Med28Q920D3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Med28Q920D3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Med28Q920D3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Med28Q920D3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Med28Q920D3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Med28Q920D3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Med28Q920D3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Med28Q920D3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Med28Q920D3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Med28Q920D3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Med28Q920D3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Med28Q920D3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Med28Q920D3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Med28Q920D3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Med28Q920D3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Med28Q920D3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Med28Q920D3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Med28Q920D3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Med28Q920D3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Med28Q920D3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Med28Q920D3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Med28Q920D3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Med28Q920D3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Med28Q920D3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Med28Q920D3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Med28Q920D3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Med28Q920D3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Med28Q920D3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Med28Q920D3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Med28Q920D3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Med28Q920D3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Med28Q920D3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Med28Q920D3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Med28Q920D3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Med28Q920D3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Med28Q920D3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Med28Q920D3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Med28Q920D3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Med28Q920D3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Med28Q920D3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Med28Q920D3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Med28Q920D3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Med28Q920D3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Med28Q920D3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Med28Q920D3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Med28Q920D3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Med28Q920D3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Med28Q920D3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Med28Q920D3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Med28Q920D3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Med28Q920D3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.7 ms