Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK0

Lrrc49, Leucine-rich repeat-containing protein 49, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc49Q91YK0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc49Q91YK0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrc49Q91YK0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrc49Q91YK0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrc49Q91YK0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrc49Q91YK0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrc49Q91YK0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc49Q91YK0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc49Q91YK0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc49Q91YK0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc49Q91YK0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc49Q91YK0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc49Q91YK0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc49Q91YK0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc49Q91YK0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc49Q91YK0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc49Q91YK0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc49Q91YK0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrc49Q91YK0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrc49Q91YK0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrc49Q91YK0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrc49Q91YK0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrc49Q91YK0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrc49Q91YK0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrc49Q91YK0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrc49Q91YK0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc49Q91YK0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc49Q91YK0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc49Q91YK0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc49Q91YK0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc49Q91YK0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc49Q91YK0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc49Q91YK0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrc49Q91YK0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrc49Q91YK0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrc49Q91YK0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrc49Q91YK0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrc49Q91YK0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrc49Q91YK0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrc49Q91YK0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrc49Q91YK0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrc49Q91YK0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc49Q91YK0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc49Q91YK0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc49Q91YK0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc49Q91YK0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc49Q91YK0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc49Q91YK0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrc49Q91YK0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrc49Q91YK0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrc49Q91YK0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lrrc49Q91YK0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lrrc49Q91YK0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrrc49Q91YK0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrc49Q91YK0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrc49Q91YK0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrc49Q91YK0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrc49Q91YK0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrc49Q91YK0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc49Q91YK0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc49Q91YK0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc49Q91YK0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrc49Q91YK0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrc49Q91YK0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc49Q91YK0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc49Q91YK0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc49Q91YK0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lrrc49Q91YK0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lrrc49Q91YK0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc49Q91YK0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc49Q91YK0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrc49Q91YK0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc49Q91YK0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc49Q91YK0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc49Q91YK0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc49Q91YK0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc49Q91YK0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc49Q91YK0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc49Q91YK0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc49Q91YK0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc49Q91YK0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc49Q91YK0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc49Q91YK0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc49Q91YK0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc49Q91YK0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc49Q91YK0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc49Q91YK0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc49Q91YK0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc49Q91YK0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc49Q91YK0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc49Q91YK0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc49Q91YK0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc49Q91YK0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc49Q91YK0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc49Q91YK0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc49Q91YK0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc49Q91YK0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc49Q91YK0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Lrrc49Q91YK0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Lrrc49Q91YK0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms