Protein–RNA interactions for Protein: Q91YJ2

Snx4, Sorting nexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx4Q91YJ2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx4Q91YJ2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx4Q91YJ2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx4Q91YJ2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snx4Q91YJ2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snx4Q91YJ2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snx4Q91YJ2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx4Q91YJ2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx4Q91YJ2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx4Q91YJ2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx4Q91YJ2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx4Q91YJ2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx4Q91YJ2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx4Q91YJ2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx4Q91YJ2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx4Q91YJ2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx4Q91YJ2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx4Q91YJ2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx4Q91YJ2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx4Q91YJ2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx4Q91YJ2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx4Q91YJ2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx4Q91YJ2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Snx4Q91YJ2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Snx4Q91YJ2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Snx4Q91YJ2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snx4Q91YJ2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snx4Q91YJ2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx4Q91YJ2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx4Q91YJ2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx4Q91YJ2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx4Q91YJ2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx4Q91YJ2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx4Q91YJ2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx4Q91YJ2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx4Q91YJ2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx4Q91YJ2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx4Q91YJ2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx4Q91YJ2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx4Q91YJ2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx4Q91YJ2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx4Q91YJ2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx4Q91YJ2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx4Q91YJ2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx4Q91YJ2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx4Q91YJ2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx4Q91YJ2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx4Q91YJ2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx4Q91YJ2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx4Q91YJ2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snx4Q91YJ2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx4Q91YJ2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx4Q91YJ2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx4Q91YJ2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx4Q91YJ2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx4Q91YJ2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx4Q91YJ2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx4Q91YJ2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx4Q91YJ2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx4Q91YJ2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx4Q91YJ2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx4Q91YJ2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx4Q91YJ2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx4Q91YJ2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx4Q91YJ2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx4Q91YJ2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx4Q91YJ2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx4Q91YJ2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx4Q91YJ2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx4Q91YJ2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx4Q91YJ2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx4Q91YJ2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx4Q91YJ2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx4Q91YJ2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx4Q91YJ2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx4Q91YJ2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx4Q91YJ2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx4Q91YJ2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx4Q91YJ2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx4Q91YJ2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx4Q91YJ2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx4Q91YJ2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx4Q91YJ2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx4Q91YJ2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx4Q91YJ2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx4Q91YJ2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx4Q91YJ2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx4Q91YJ2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx4Q91YJ2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx4Q91YJ2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx4Q91YJ2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx4Q91YJ2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Snx4Q91YJ2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snx4Q91YJ2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx4Q91YJ2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx4Q91YJ2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx4Q91YJ2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx4Q91YJ2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx4Q91YJ2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx4Q91YJ2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms