Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y15

Pcdha5, Protocadherin alpha 5, mousemouse

Predictions only

Length 934 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha5Q91Y15 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcdha5Q91Y15 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcdha5Q91Y15 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pcdha5Q91Y15 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pcdha5Q91Y15 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pcdha5Q91Y15 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pcdha5Q91Y15 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pcdha5Q91Y15 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pcdha5Q91Y15 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcdha5Q91Y15 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcdha5Q91Y15 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcdha5Q91Y15 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcdha5Q91Y15 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pcdha5Q91Y15 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pcdha5Q91Y15 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pcdha5Q91Y15 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcdha5Q91Y15 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcdha5Q91Y15 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcdha5Q91Y15 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcdha5Q91Y15 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pcdha5Q91Y15 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pcdha5Q91Y15 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pcdha5Q91Y15 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pcdha5Q91Y15 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Pcdha5Q91Y15 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Pcdha5Q91Y15 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pcdha5Q91Y15 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcdha5Q91Y15 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcdha5Q91Y15 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcdha5Q91Y15 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcdha5Q91Y15 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcdha5Q91Y15 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcdha5Q91Y15 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcdha5Q91Y15 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcdha5Q91Y15 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcdha5Q91Y15 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcdha5Q91Y15 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pcdha5Q91Y15 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pcdha5Q91Y15 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pcdha5Q91Y15 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Pcdha5Q91Y15 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pcdha5Q91Y15 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pcdha5Q91Y15 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pcdha5Q91Y15 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pcdha5Q91Y15 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pcdha5Q91Y15 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcdha5Q91Y15 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcdha5Q91Y15 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcdha5Q91Y15 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcdha5Q91Y15 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pcdha5Q91Y15 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcdha5Q91Y15 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcdha5Q91Y15 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pcdha5Q91Y15 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pcdha5Q91Y15 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pcdha5Q91Y15 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pcdha5Q91Y15 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcdha5Q91Y15 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcdha5Q91Y15 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pcdha5Q91Y15 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pcdha5Q91Y15 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pcdha5Q91Y15 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pcdha5Q91Y15 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pcdha5Q91Y15 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pcdha5Q91Y15 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pcdha5Q91Y15 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pcdha5Q91Y15 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pcdha5Q91Y15 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pcdha5Q91Y15 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Pcdha5Q91Y15 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pcdha5Q91Y15 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Pcdha5Q91Y15 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcdha5Q91Y15 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcdha5Q91Y15 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Pcdha5Q91Y15 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pcdha5Q91Y15 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pcdha5Q91Y15 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pcdha5Q91Y15 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pcdha5Q91Y15 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pcdha5Q91Y15 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pcdha5Q91Y15 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pcdha5Q91Y15 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pcdha5Q91Y15 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcdha5Q91Y15 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcdha5Q91Y15 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcdha5Q91Y15 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcdha5Q91Y15 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcdha5Q91Y15 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcdha5Q91Y15 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcdha5Q91Y15 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcdha5Q91Y15 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcdha5Q91Y15 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcdha5Q91Y15 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcdha5Q91Y15 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcdha5Q91Y15 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcdha5Q91Y15 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcdha5Q91Y15 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcdha5Q91Y15 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcdha5Q91Y15 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcdha5Q91Y15 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms