Protein–RNA interactions for Protein: Q91WA1

Tipin, TIMELESS-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TipinQ91WA1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TipinQ91WA1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TipinQ91WA1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TipinQ91WA1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TipinQ91WA1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TipinQ91WA1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TipinQ91WA1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TipinQ91WA1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TipinQ91WA1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TipinQ91WA1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TipinQ91WA1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TipinQ91WA1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TipinQ91WA1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TipinQ91WA1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TipinQ91WA1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TipinQ91WA1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TipinQ91WA1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TipinQ91WA1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TipinQ91WA1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TipinQ91WA1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TipinQ91WA1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TipinQ91WA1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TipinQ91WA1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TipinQ91WA1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TipinQ91WA1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TipinQ91WA1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TipinQ91WA1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TipinQ91WA1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TipinQ91WA1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TipinQ91WA1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TipinQ91WA1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TipinQ91WA1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TipinQ91WA1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TipinQ91WA1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TipinQ91WA1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TipinQ91WA1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TipinQ91WA1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TipinQ91WA1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TipinQ91WA1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TipinQ91WA1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TipinQ91WA1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TipinQ91WA1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TipinQ91WA1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TipinQ91WA1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TipinQ91WA1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TipinQ91WA1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
TipinQ91WA1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TipinQ91WA1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TipinQ91WA1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TipinQ91WA1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TipinQ91WA1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TipinQ91WA1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TipinQ91WA1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TipinQ91WA1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TipinQ91WA1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TipinQ91WA1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TipinQ91WA1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TipinQ91WA1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TipinQ91WA1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TipinQ91WA1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TipinQ91WA1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TipinQ91WA1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TipinQ91WA1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TipinQ91WA1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TipinQ91WA1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TipinQ91WA1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TipinQ91WA1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TipinQ91WA1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TipinQ91WA1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TipinQ91WA1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TipinQ91WA1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TipinQ91WA1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TipinQ91WA1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TipinQ91WA1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TipinQ91WA1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TipinQ91WA1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TipinQ91WA1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TipinQ91WA1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TipinQ91WA1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TipinQ91WA1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TipinQ91WA1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TipinQ91WA1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TipinQ91WA1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TipinQ91WA1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TipinQ91WA1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TipinQ91WA1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TipinQ91WA1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TipinQ91WA1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TipinQ91WA1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TipinQ91WA1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TipinQ91WA1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TipinQ91WA1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TipinQ91WA1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TipinQ91WA1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TipinQ91WA1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TipinQ91WA1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TipinQ91WA1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TipinQ91WA1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TipinQ91WA1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TipinQ91WA1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms