Protein–RNA interactions for Protein: Q91VK4

Itm2c, Integral membrane protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itm2cQ91VK4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Itm2cQ91VK4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Itm2cQ91VK4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Itm2cQ91VK4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Itm2cQ91VK4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Itm2cQ91VK4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Itm2cQ91VK4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Itm2cQ91VK4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Itm2cQ91VK4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Itm2cQ91VK4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Itm2cQ91VK4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Itm2cQ91VK4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Itm2cQ91VK4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Itm2cQ91VK4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Itm2cQ91VK4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Itm2cQ91VK4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Itm2cQ91VK4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Itm2cQ91VK4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Itm2cQ91VK4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Itm2cQ91VK4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Itm2cQ91VK4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Itm2cQ91VK4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Itm2cQ91VK4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Itm2cQ91VK4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Itm2cQ91VK4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Itm2cQ91VK4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Itm2cQ91VK4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Itm2cQ91VK4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Itm2cQ91VK4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Itm2cQ91VK4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Itm2cQ91VK4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Itm2cQ91VK4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Itm2cQ91VK4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Itm2cQ91VK4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Itm2cQ91VK4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Itm2cQ91VK4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Itm2cQ91VK4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Itm2cQ91VK4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Itm2cQ91VK4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Itm2cQ91VK4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Itm2cQ91VK4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Itm2cQ91VK4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Itm2cQ91VK4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Itm2cQ91VK4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Itm2cQ91VK4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Itm2cQ91VK4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Itm2cQ91VK4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Itm2cQ91VK4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Itm2cQ91VK4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Itm2cQ91VK4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Itm2cQ91VK4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Itm2cQ91VK4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Itm2cQ91VK4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Itm2cQ91VK4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Itm2cQ91VK4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Itm2cQ91VK4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Itm2cQ91VK4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Itm2cQ91VK4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Itm2cQ91VK4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Itm2cQ91VK4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Itm2cQ91VK4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Itm2cQ91VK4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Itm2cQ91VK4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Itm2cQ91VK4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Itm2cQ91VK4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Itm2cQ91VK4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Itm2cQ91VK4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Itm2cQ91VK4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Itm2cQ91VK4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Itm2cQ91VK4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Itm2cQ91VK4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Itm2cQ91VK4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Itm2cQ91VK4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Itm2cQ91VK4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Itm2cQ91VK4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Itm2cQ91VK4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Itm2cQ91VK4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Itm2cQ91VK4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Itm2cQ91VK4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Itm2cQ91VK4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Itm2cQ91VK4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Itm2cQ91VK4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Itm2cQ91VK4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Itm2cQ91VK4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Itm2cQ91VK4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Itm2cQ91VK4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Itm2cQ91VK4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Itm2cQ91VK4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Itm2cQ91VK4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Itm2cQ91VK4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Itm2cQ91VK4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Itm2cQ91VK4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Itm2cQ91VK4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Itm2cQ91VK4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Itm2cQ91VK4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Itm2cQ91VK4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Itm2cQ91VK4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Itm2cQ91VK4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Itm2cQ91VK4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Itm2cQ91VK4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms