Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Ppargc1bQ8VHJ7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Ppargc1bQ8VHJ7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Ppargc1bQ8VHJ7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
Ppargc1bQ8VHJ7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Ppargc1bQ8VHJ7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Ppargc1bQ8VHJ7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Ppargc1bQ8VHJ7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Ppargc1bQ8VHJ7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Ppargc1bQ8VHJ7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Ppargc1bQ8VHJ7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Ppargc1bQ8VHJ7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
Ppargc1bQ8VHJ7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Ppargc1bQ8VHJ7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Ppargc1bQ8VHJ7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Ppargc1bQ8VHJ7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Ppargc1bQ8VHJ7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Ppargc1bQ8VHJ7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms