Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC38.3■■■■□ 3.72
Cul7Q8VE73 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Cul7Q8VE73 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
Cul7Q8VE73 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Cul7Q8VE73 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC38.25■■■■□ 3.71
Cul7Q8VE73 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
Cul7Q8VE73 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Cul7Q8VE73 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Cul7Q8VE73 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Cul7Q8VE73 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Cul7Q8VE73 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Cul7Q8VE73 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Cul7Q8VE73 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Cul7Q8VE73 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
Cul7Q8VE73 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Cul7Q8VE73 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
Cul7Q8VE73 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC38.15■■■■□ 3.7
Cul7Q8VE73 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
Cul7Q8VE73 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Cul7Q8VE73 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
Cul7Q8VE73 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Cul7Q8VE73 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC38.1■■■■□ 3.69
Cul7Q8VE73 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Cul7Q8VE73 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Cul7Q8VE73 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
Cul7Q8VE73 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
Cul7Q8VE73 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Cul7Q8VE73 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
Cul7Q8VE73 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Cul7Q8VE73 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Cul7Q8VE73 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Cul7Q8VE73 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Cul7Q8VE73 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
Cul7Q8VE73 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC37.97■■■■□ 3.67
Cul7Q8VE73 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Cul7Q8VE73 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Cul7Q8VE73 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.66
Cul7Q8VE73 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.66
Cul7Q8VE73 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Cul7Q8VE73 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
Cul7Q8VE73 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Cul7Q8VE73 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC37.91■■■■□ 3.66
Cul7Q8VE73 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Cul7Q8VE73 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
Cul7Q8VE73 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.66
Cul7Q8VE73 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Cul7Q8VE73 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Cul7Q8VE73 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Cul7Q8VE73 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Cul7Q8VE73 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC37.86■■■■□ 3.65
Cul7Q8VE73 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC37.85■■■■□ 3.65
Cul7Q8VE73 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
Cul7Q8VE73 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Cul7Q8VE73 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Cul7Q8VE73 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Cul7Q8VE73 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Cul7Q8VE73 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
Cul7Q8VE73 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
Cul7Q8VE73 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
Cul7Q8VE73 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Cul7Q8VE73 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC37.8■■■■□ 3.64
Cul7Q8VE73 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Cul7Q8VE73 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Cul7Q8VE73 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Cul7Q8VE73 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
Cul7Q8VE73 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Cul7Q8VE73 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC37.77■■■■□ 3.64
Cul7Q8VE73 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Cul7Q8VE73 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC37.76■■■■□ 3.64
Cul7Q8VE73 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Cul7Q8VE73 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Cul7Q8VE73 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Cul7Q8VE73 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Cul7Q8VE73 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Cul7Q8VE73 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Cul7Q8VE73 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Cul7Q8VE73 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Cul7Q8VE73 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
Cul7Q8VE73 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC37.71■■■■□ 3.63
Cul7Q8VE73 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Cul7Q8VE73 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
Cul7Q8VE73 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Cul7Q8VE73 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Cul7Q8VE73 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
Cul7Q8VE73 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Cul7Q8VE73 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Cul7Q8VE73 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
Cul7Q8VE73 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Cul7Q8VE73 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Cul7Q8VE73 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
Cul7Q8VE73 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
Cul7Q8VE73 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Cul7Q8VE73 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Cul7Q8VE73 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Cul7Q8VE73 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Cul7Q8VE73 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
Cul7Q8VE73 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Cul7Q8VE73 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
Cul7Q8VE73 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC37.58■■■■□ 3.61
Cul7Q8VE73 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms