Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4D1

Slc9a8, Sodium/hydrogen exchanger 8, mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a8Q8R4D1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc9a8Q8R4D1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc9a8Q8R4D1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc9a8Q8R4D1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc9a8Q8R4D1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc9a8Q8R4D1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc9a8Q8R4D1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc9a8Q8R4D1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc9a8Q8R4D1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc9a8Q8R4D1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc9a8Q8R4D1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc9a8Q8R4D1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc9a8Q8R4D1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc9a8Q8R4D1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc9a8Q8R4D1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc9a8Q8R4D1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc9a8Q8R4D1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc9a8Q8R4D1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc9a8Q8R4D1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc9a8Q8R4D1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc9a8Q8R4D1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc9a8Q8R4D1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc9a8Q8R4D1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc9a8Q8R4D1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc9a8Q8R4D1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc9a8Q8R4D1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc9a8Q8R4D1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc9a8Q8R4D1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc9a8Q8R4D1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc9a8Q8R4D1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc9a8Q8R4D1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc9a8Q8R4D1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc9a8Q8R4D1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc9a8Q8R4D1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc9a8Q8R4D1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc9a8Q8R4D1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc9a8Q8R4D1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc9a8Q8R4D1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc9a8Q8R4D1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc9a8Q8R4D1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc9a8Q8R4D1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc9a8Q8R4D1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc9a8Q8R4D1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc9a8Q8R4D1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc9a8Q8R4D1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc9a8Q8R4D1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc9a8Q8R4D1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc9a8Q8R4D1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc9a8Q8R4D1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc9a8Q8R4D1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc9a8Q8R4D1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc9a8Q8R4D1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc9a8Q8R4D1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc9a8Q8R4D1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc9a8Q8R4D1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc9a8Q8R4D1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc9a8Q8R4D1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc9a8Q8R4D1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc9a8Q8R4D1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc9a8Q8R4D1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc9a8Q8R4D1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc9a8Q8R4D1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc9a8Q8R4D1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc9a8Q8R4D1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc9a8Q8R4D1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc9a8Q8R4D1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc9a8Q8R4D1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc9a8Q8R4D1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc9a8Q8R4D1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc9a8Q8R4D1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc9a8Q8R4D1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc9a8Q8R4D1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc9a8Q8R4D1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc9a8Q8R4D1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc9a8Q8R4D1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc9a8Q8R4D1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc9a8Q8R4D1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc9a8Q8R4D1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc9a8Q8R4D1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc9a8Q8R4D1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc9a8Q8R4D1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc9a8Q8R4D1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc9a8Q8R4D1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc9a8Q8R4D1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc9a8Q8R4D1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc9a8Q8R4D1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc9a8Q8R4D1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc9a8Q8R4D1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc9a8Q8R4D1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc9a8Q8R4D1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc9a8Q8R4D1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc9a8Q8R4D1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc9a8Q8R4D1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc9a8Q8R4D1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc9a8Q8R4D1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc9a8Q8R4D1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc9a8Q8R4D1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc9a8Q8R4D1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc9a8Q8R4D1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc9a8Q8R4D1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms