Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3P9

Slf1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf1Q8R3P9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slf1Q8R3P9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slf1Q8R3P9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slf1Q8R3P9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slf1Q8R3P9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slf1Q8R3P9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slf1Q8R3P9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slf1Q8R3P9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slf1Q8R3P9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slf1Q8R3P9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slf1Q8R3P9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slf1Q8R3P9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slf1Q8R3P9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slf1Q8R3P9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slf1Q8R3P9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slf1Q8R3P9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slf1Q8R3P9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slf1Q8R3P9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slf1Q8R3P9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slf1Q8R3P9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slf1Q8R3P9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slf1Q8R3P9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slf1Q8R3P9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slf1Q8R3P9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slf1Q8R3P9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Slf1Q8R3P9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slf1Q8R3P9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slf1Q8R3P9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slf1Q8R3P9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slf1Q8R3P9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slf1Q8R3P9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slf1Q8R3P9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Slf1Q8R3P9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slf1Q8R3P9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slf1Q8R3P9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slf1Q8R3P9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slf1Q8R3P9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Slf1Q8R3P9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slf1Q8R3P9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slf1Q8R3P9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slf1Q8R3P9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slf1Q8R3P9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Slf1Q8R3P9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slf1Q8R3P9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slf1Q8R3P9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slf1Q8R3P9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slf1Q8R3P9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slf1Q8R3P9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slf1Q8R3P9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slf1Q8R3P9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slf1Q8R3P9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Slf1Q8R3P9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slf1Q8R3P9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slf1Q8R3P9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slf1Q8R3P9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slf1Q8R3P9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slf1Q8R3P9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slf1Q8R3P9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slf1Q8R3P9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slf1Q8R3P9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slf1Q8R3P9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slf1Q8R3P9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slf1Q8R3P9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slf1Q8R3P9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slf1Q8R3P9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Slf1Q8R3P9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slf1Q8R3P9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slf1Q8R3P9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slf1Q8R3P9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slf1Q8R3P9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slf1Q8R3P9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slf1Q8R3P9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slf1Q8R3P9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Slf1Q8R3P9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slf1Q8R3P9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slf1Q8R3P9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slf1Q8R3P9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slf1Q8R3P9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slf1Q8R3P9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slf1Q8R3P9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slf1Q8R3P9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slf1Q8R3P9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slf1Q8R3P9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slf1Q8R3P9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slf1Q8R3P9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slf1Q8R3P9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slf1Q8R3P9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slf1Q8R3P9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slf1Q8R3P9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slf1Q8R3P9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slf1Q8R3P9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slf1Q8R3P9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slf1Q8R3P9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slf1Q8R3P9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slf1Q8R3P9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slf1Q8R3P9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slf1Q8R3P9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slf1Q8R3P9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slf1Q8R3P9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slf1Q8R3P9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms