Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2T8

Gtf3c5, General transcription factor 3C polypeptide 5, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c5Q8R2T8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Gtf3c5Q8R2T8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Gtf3c5Q8R2T8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gtf3c5Q8R2T8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gtf3c5Q8R2T8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gtf3c5Q8R2T8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gtf3c5Q8R2T8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gtf3c5Q8R2T8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gtf3c5Q8R2T8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gtf3c5Q8R2T8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Gtf3c5Q8R2T8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gtf3c5Q8R2T8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gtf3c5Q8R2T8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gtf3c5Q8R2T8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gtf3c5Q8R2T8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gtf3c5Q8R2T8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Gtf3c5Q8R2T8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gtf3c5Q8R2T8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gtf3c5Q8R2T8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gtf3c5Q8R2T8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gtf3c5Q8R2T8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gtf3c5Q8R2T8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gtf3c5Q8R2T8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gtf3c5Q8R2T8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gtf3c5Q8R2T8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gtf3c5Q8R2T8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gtf3c5Q8R2T8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gtf3c5Q8R2T8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gtf3c5Q8R2T8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gtf3c5Q8R2T8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gtf3c5Q8R2T8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Gtf3c5Q8R2T8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gtf3c5Q8R2T8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gtf3c5Q8R2T8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gtf3c5Q8R2T8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gtf3c5Q8R2T8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gtf3c5Q8R2T8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gtf3c5Q8R2T8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gtf3c5Q8R2T8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gtf3c5Q8R2T8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gtf3c5Q8R2T8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gtf3c5Q8R2T8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gtf3c5Q8R2T8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gtf3c5Q8R2T8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Gtf3c5Q8R2T8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gtf3c5Q8R2T8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gtf3c5Q8R2T8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gtf3c5Q8R2T8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Gtf3c5Q8R2T8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Gtf3c5Q8R2T8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gtf3c5Q8R2T8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gtf3c5Q8R2T8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gtf3c5Q8R2T8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gtf3c5Q8R2T8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gtf3c5Q8R2T8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gtf3c5Q8R2T8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gtf3c5Q8R2T8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gtf3c5Q8R2T8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Gtf3c5Q8R2T8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gtf3c5Q8R2T8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gtf3c5Q8R2T8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gtf3c5Q8R2T8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gtf3c5Q8R2T8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gtf3c5Q8R2T8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gtf3c5Q8R2T8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gtf3c5Q8R2T8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Gtf3c5Q8R2T8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gtf3c5Q8R2T8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gtf3c5Q8R2T8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gtf3c5Q8R2T8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gtf3c5Q8R2T8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gtf3c5Q8R2T8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gtf3c5Q8R2T8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gtf3c5Q8R2T8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gtf3c5Q8R2T8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gtf3c5Q8R2T8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gtf3c5Q8R2T8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gtf3c5Q8R2T8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gtf3c5Q8R2T8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gtf3c5Q8R2T8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gtf3c5Q8R2T8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gtf3c5Q8R2T8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gtf3c5Q8R2T8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gtf3c5Q8R2T8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Gtf3c5Q8R2T8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Gtf3c5Q8R2T8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Gtf3c5Q8R2T8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gtf3c5Q8R2T8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gtf3c5Q8R2T8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gtf3c5Q8R2T8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gtf3c5Q8R2T8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gtf3c5Q8R2T8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gtf3c5Q8R2T8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gtf3c5Q8R2T8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gtf3c5Q8R2T8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gtf3c5Q8R2T8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Gtf3c5Q8R2T8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gtf3c5Q8R2T8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gtf3c5Q8R2T8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Gtf3c5Q8R2T8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms