Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1S9

Slc38a4, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 4, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a4Q8R1S9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc38a4Q8R1S9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc38a4Q8R1S9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc38a4Q8R1S9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc38a4Q8R1S9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc38a4Q8R1S9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc38a4Q8R1S9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc38a4Q8R1S9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc38a4Q8R1S9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc38a4Q8R1S9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc38a4Q8R1S9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc38a4Q8R1S9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc38a4Q8R1S9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc38a4Q8R1S9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slc38a4Q8R1S9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc38a4Q8R1S9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc38a4Q8R1S9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc38a4Q8R1S9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc38a4Q8R1S9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc38a4Q8R1S9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc38a4Q8R1S9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc38a4Q8R1S9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc38a4Q8R1S9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc38a4Q8R1S9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc38a4Q8R1S9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc38a4Q8R1S9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc38a4Q8R1S9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Slc38a4Q8R1S9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Slc38a4Q8R1S9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc38a4Q8R1S9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc38a4Q8R1S9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc38a4Q8R1S9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc38a4Q8R1S9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc38a4Q8R1S9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc38a4Q8R1S9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc38a4Q8R1S9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc38a4Q8R1S9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc38a4Q8R1S9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc38a4Q8R1S9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc38a4Q8R1S9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc38a4Q8R1S9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc38a4Q8R1S9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc38a4Q8R1S9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc38a4Q8R1S9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc38a4Q8R1S9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc38a4Q8R1S9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc38a4Q8R1S9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc38a4Q8R1S9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc38a4Q8R1S9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc38a4Q8R1S9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Slc38a4Q8R1S9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc38a4Q8R1S9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc38a4Q8R1S9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc38a4Q8R1S9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc38a4Q8R1S9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc38a4Q8R1S9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc38a4Q8R1S9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc38a4Q8R1S9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc38a4Q8R1S9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc38a4Q8R1S9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc38a4Q8R1S9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc38a4Q8R1S9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc38a4Q8R1S9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc38a4Q8R1S9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc38a4Q8R1S9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc38a4Q8R1S9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc38a4Q8R1S9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc38a4Q8R1S9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc38a4Q8R1S9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc38a4Q8R1S9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc38a4Q8R1S9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc38a4Q8R1S9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Slc38a4Q8R1S9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc38a4Q8R1S9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc38a4Q8R1S9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc38a4Q8R1S9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc38a4Q8R1S9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc38a4Q8R1S9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc38a4Q8R1S9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc38a4Q8R1S9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc38a4Q8R1S9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc38a4Q8R1S9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc38a4Q8R1S9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc38a4Q8R1S9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc38a4Q8R1S9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc38a4Q8R1S9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc38a4Q8R1S9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc38a4Q8R1S9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc38a4Q8R1S9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc38a4Q8R1S9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc38a4Q8R1S9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc38a4Q8R1S9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc38a4Q8R1S9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc38a4Q8R1S9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc38a4Q8R1S9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc38a4Q8R1S9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc38a4Q8R1S9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc38a4Q8R1S9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc38a4Q8R1S9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc38a4Q8R1S9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms