Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1N4

Nudcd3, NudC domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd3Q8R1N4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nudcd3Q8R1N4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nudcd3Q8R1N4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nudcd3Q8R1N4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nudcd3Q8R1N4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nudcd3Q8R1N4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nudcd3Q8R1N4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nudcd3Q8R1N4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nudcd3Q8R1N4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nudcd3Q8R1N4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nudcd3Q8R1N4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nudcd3Q8R1N4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nudcd3Q8R1N4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Nudcd3Q8R1N4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nudcd3Q8R1N4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nudcd3Q8R1N4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nudcd3Q8R1N4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nudcd3Q8R1N4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nudcd3Q8R1N4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nudcd3Q8R1N4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nudcd3Q8R1N4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Nudcd3Q8R1N4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nudcd3Q8R1N4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nudcd3Q8R1N4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nudcd3Q8R1N4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nudcd3Q8R1N4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Nudcd3Q8R1N4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nudcd3Q8R1N4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nudcd3Q8R1N4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nudcd3Q8R1N4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nudcd3Q8R1N4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nudcd3Q8R1N4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Nudcd3Q8R1N4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nudcd3Q8R1N4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nudcd3Q8R1N4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nudcd3Q8R1N4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nudcd3Q8R1N4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nudcd3Q8R1N4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nudcd3Q8R1N4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nudcd3Q8R1N4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nudcd3Q8R1N4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nudcd3Q8R1N4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nudcd3Q8R1N4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nudcd3Q8R1N4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nudcd3Q8R1N4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nudcd3Q8R1N4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nudcd3Q8R1N4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nudcd3Q8R1N4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nudcd3Q8R1N4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nudcd3Q8R1N4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nudcd3Q8R1N4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Nudcd3Q8R1N4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nudcd3Q8R1N4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nudcd3Q8R1N4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nudcd3Q8R1N4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Nudcd3Q8R1N4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nudcd3Q8R1N4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nudcd3Q8R1N4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nudcd3Q8R1N4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nudcd3Q8R1N4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nudcd3Q8R1N4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nudcd3Q8R1N4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nudcd3Q8R1N4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nudcd3Q8R1N4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nudcd3Q8R1N4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nudcd3Q8R1N4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nudcd3Q8R1N4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nudcd3Q8R1N4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nudcd3Q8R1N4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nudcd3Q8R1N4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nudcd3Q8R1N4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nudcd3Q8R1N4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nudcd3Q8R1N4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nudcd3Q8R1N4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nudcd3Q8R1N4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nudcd3Q8R1N4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nudcd3Q8R1N4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nudcd3Q8R1N4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nudcd3Q8R1N4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nudcd3Q8R1N4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nudcd3Q8R1N4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nudcd3Q8R1N4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nudcd3Q8R1N4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nudcd3Q8R1N4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nudcd3Q8R1N4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nudcd3Q8R1N4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nudcd3Q8R1N4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nudcd3Q8R1N4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nudcd3Q8R1N4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nudcd3Q8R1N4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nudcd3Q8R1N4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nudcd3Q8R1N4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nudcd3Q8R1N4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nudcd3Q8R1N4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nudcd3Q8R1N4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nudcd3Q8R1N4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nudcd3Q8R1N4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nudcd3Q8R1N4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nudcd3Q8R1N4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nudcd3Q8R1N4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms