Protein–RNA interactions for Protein: Q8R105

Vps37c, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps37cQ8R105 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vps37cQ8R105 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vps37cQ8R105 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vps37cQ8R105 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vps37cQ8R105 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vps37cQ8R105 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vps37cQ8R105 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vps37cQ8R105 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vps37cQ8R105 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vps37cQ8R105 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vps37cQ8R105 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vps37cQ8R105 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vps37cQ8R105 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vps37cQ8R105 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vps37cQ8R105 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Vps37cQ8R105 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Vps37cQ8R105 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vps37cQ8R105 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vps37cQ8R105 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vps37cQ8R105 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vps37cQ8R105 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Vps37cQ8R105 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vps37cQ8R105 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vps37cQ8R105 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vps37cQ8R105 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Vps37cQ8R105 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vps37cQ8R105 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vps37cQ8R105 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vps37cQ8R105 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vps37cQ8R105 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vps37cQ8R105 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vps37cQ8R105 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vps37cQ8R105 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vps37cQ8R105 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vps37cQ8R105 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vps37cQ8R105 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vps37cQ8R105 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vps37cQ8R105 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Vps37cQ8R105 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Vps37cQ8R105 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vps37cQ8R105 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vps37cQ8R105 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vps37cQ8R105 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vps37cQ8R105 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vps37cQ8R105 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vps37cQ8R105 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vps37cQ8R105 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vps37cQ8R105 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vps37cQ8R105 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vps37cQ8R105 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vps37cQ8R105 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vps37cQ8R105 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vps37cQ8R105 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vps37cQ8R105 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vps37cQ8R105 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vps37cQ8R105 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vps37cQ8R105 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vps37cQ8R105 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vps37cQ8R105 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vps37cQ8R105 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vps37cQ8R105 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Vps37cQ8R105 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vps37cQ8R105 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vps37cQ8R105 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vps37cQ8R105 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vps37cQ8R105 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vps37cQ8R105 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Vps37cQ8R105 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Vps37cQ8R105 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vps37cQ8R105 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Vps37cQ8R105 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vps37cQ8R105 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vps37cQ8R105 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vps37cQ8R105 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vps37cQ8R105 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vps37cQ8R105 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vps37cQ8R105 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vps37cQ8R105 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vps37cQ8R105 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Vps37cQ8R105 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vps37cQ8R105 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vps37cQ8R105 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vps37cQ8R105 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vps37cQ8R105 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vps37cQ8R105 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vps37cQ8R105 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vps37cQ8R105 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vps37cQ8R105 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vps37cQ8R105 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vps37cQ8R105 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vps37cQ8R105 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Vps37cQ8R105 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vps37cQ8R105 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vps37cQ8R105 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vps37cQ8R105 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vps37cQ8R105 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vps37cQ8R105 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vps37cQ8R105 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vps37cQ8R105 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vps37cQ8R105 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms