Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
Hecw1Q8K4P8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
Hecw1Q8K4P8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Hecw1Q8K4P8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Hecw1Q8K4P8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Hecw1Q8K4P8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Hecw1Q8K4P8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
Hecw1Q8K4P8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Hecw1Q8K4P8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Hecw1Q8K4P8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Hecw1Q8K4P8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC36.88■■■■□ 3.49
Hecw1Q8K4P8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
Hecw1Q8K4P8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Hecw1Q8K4P8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Hecw1Q8K4P8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Hecw1Q8K4P8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Hecw1Q8K4P8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Hecw1Q8K4P8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
Hecw1Q8K4P8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Hecw1Q8K4P8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Hecw1Q8K4P8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Hecw1Q8K4P8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC36.77■■■■□ 3.48
Hecw1Q8K4P8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Hecw1Q8K4P8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Hecw1Q8K4P8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
Hecw1Q8K4P8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Hecw1Q8K4P8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Hecw1Q8K4P8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
Hecw1Q8K4P8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Hecw1Q8K4P8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Hecw1Q8K4P8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Hecw1Q8K4P8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Hecw1Q8K4P8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Hecw1Q8K4P8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Hecw1Q8K4P8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Hecw1Q8K4P8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Hecw1Q8K4P8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
Hecw1Q8K4P8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Hecw1Q8K4P8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Hecw1Q8K4P8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Hecw1Q8K4P8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Hecw1Q8K4P8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Hecw1Q8K4P8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Hecw1Q8K4P8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Hecw1Q8K4P8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Hecw1Q8K4P8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Hecw1Q8K4P8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Hecw1Q8K4P8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Hecw1Q8K4P8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Hecw1Q8K4P8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
Hecw1Q8K4P8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Hecw1Q8K4P8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Hecw1Q8K4P8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Hecw1Q8K4P8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Hecw1Q8K4P8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Hecw1Q8K4P8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Hecw1Q8K4P8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Hecw1Q8K4P8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Hecw1Q8K4P8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Hecw1Q8K4P8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
Hecw1Q8K4P8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
Hecw1Q8K4P8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Hecw1Q8K4P8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Hecw1Q8K4P8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Hecw1Q8K4P8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Hecw1Q8K4P8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Hecw1Q8K4P8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Hecw1Q8K4P8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Hecw1Q8K4P8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Hecw1Q8K4P8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Hecw1Q8K4P8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Hecw1Q8K4P8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Hecw1Q8K4P8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Hecw1Q8K4P8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Hecw1Q8K4P8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Hecw1Q8K4P8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Hecw1Q8K4P8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Hecw1Q8K4P8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Hecw1Q8K4P8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Hecw1Q8K4P8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Hecw1Q8K4P8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Hecw1Q8K4P8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Hecw1Q8K4P8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Hecw1Q8K4P8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Hecw1Q8K4P8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
Hecw1Q8K4P8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
Hecw1Q8K4P8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Hecw1Q8K4P8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Hecw1Q8K4P8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Hecw1Q8K4P8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Hecw1Q8K4P8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Hecw1Q8K4P8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Hecw1Q8K4P8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
Hecw1Q8K4P8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Hecw1Q8K4P8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Hecw1Q8K4P8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Hecw1Q8K4P8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Hecw1Q8K4P8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Hecw1Q8K4P8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Hecw1Q8K4P8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms