Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y7

Mrpl47, 39S ribosomal protein L47, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl47Q8K2Y7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mrpl47Q8K2Y7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mrpl47Q8K2Y7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mrpl47Q8K2Y7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mrpl47Q8K2Y7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mrpl47Q8K2Y7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mrpl47Q8K2Y7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mrpl47Q8K2Y7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mrpl47Q8K2Y7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Mrpl47Q8K2Y7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mrpl47Q8K2Y7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mrpl47Q8K2Y7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mrpl47Q8K2Y7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mrpl47Q8K2Y7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mrpl47Q8K2Y7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mrpl47Q8K2Y7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mrpl47Q8K2Y7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mrpl47Q8K2Y7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mrpl47Q8K2Y7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mrpl47Q8K2Y7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mrpl47Q8K2Y7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mrpl47Q8K2Y7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mrpl47Q8K2Y7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mrpl47Q8K2Y7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mrpl47Q8K2Y7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mrpl47Q8K2Y7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mrpl47Q8K2Y7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mrpl47Q8K2Y7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mrpl47Q8K2Y7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mrpl47Q8K2Y7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mrpl47Q8K2Y7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mrpl47Q8K2Y7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mrpl47Q8K2Y7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mrpl47Q8K2Y7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mrpl47Q8K2Y7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Mrpl47Q8K2Y7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mrpl47Q8K2Y7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mrpl47Q8K2Y7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mrpl47Q8K2Y7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mrpl47Q8K2Y7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Mrpl47Q8K2Y7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mrpl47Q8K2Y7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mrpl47Q8K2Y7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mrpl47Q8K2Y7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mrpl47Q8K2Y7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mrpl47Q8K2Y7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mrpl47Q8K2Y7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mrpl47Q8K2Y7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mrpl47Q8K2Y7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Mrpl47Q8K2Y7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mrpl47Q8K2Y7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mrpl47Q8K2Y7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mrpl47Q8K2Y7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mrpl47Q8K2Y7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mrpl47Q8K2Y7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mrpl47Q8K2Y7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mrpl47Q8K2Y7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mrpl47Q8K2Y7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mrpl47Q8K2Y7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mrpl47Q8K2Y7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Mrpl47Q8K2Y7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mrpl47Q8K2Y7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mrpl47Q8K2Y7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mrpl47Q8K2Y7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mrpl47Q8K2Y7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mrpl47Q8K2Y7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mrpl47Q8K2Y7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mrpl47Q8K2Y7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mrpl47Q8K2Y7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mrpl47Q8K2Y7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mrpl47Q8K2Y7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mrpl47Q8K2Y7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mrpl47Q8K2Y7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mrpl47Q8K2Y7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mrpl47Q8K2Y7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mrpl47Q8K2Y7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mrpl47Q8K2Y7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mrpl47Q8K2Y7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mrpl47Q8K2Y7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mrpl47Q8K2Y7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mrpl47Q8K2Y7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mrpl47Q8K2Y7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mrpl47Q8K2Y7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mrpl47Q8K2Y7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mrpl47Q8K2Y7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mrpl47Q8K2Y7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mrpl47Q8K2Y7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mrpl47Q8K2Y7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mrpl47Q8K2Y7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mrpl47Q8K2Y7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mrpl47Q8K2Y7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Mrpl47Q8K2Y7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mrpl47Q8K2Y7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mrpl47Q8K2Y7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mrpl47Q8K2Y7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mrpl47Q8K2Y7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mrpl47Q8K2Y7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mrpl47Q8K2Y7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mrpl47Q8K2Y7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mrpl47Q8K2Y7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms