Protein–RNA interactions for Protein: Q8K296

Mtmr3, Myotubularin-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr3Q8K296 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27,93■■■□□ 2,06
Mtmr3Q8K296 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27,93■■■□□ 2,06
Mtmr3Q8K296 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Mtmr3Q8K296 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27,92■■■□□ 2,06
Mtmr3Q8K296 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Mtmr3Q8K296 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Mtmr3Q8K296 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Mtmr3Q8K296 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,06
Mtmr3Q8K296 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27,89■■■□□ 2,06
Mtmr3Q8K296 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Mtmr3Q8K296 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Mtmr3Q8K296 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Mtmr3Q8K296 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Mtmr3Q8K296 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Mtmr3Q8K296 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,85■■■□□ 2,05
Mtmr3Q8K296 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Mtmr3Q8K296 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Mtmr3Q8K296 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27,84■■■□□ 2,05
Mtmr3Q8K296 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27,84■■■□□ 2,05
Mtmr3Q8K296 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27,83■■■□□ 2,05
Mtmr3Q8K296 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Mtmr3Q8K296 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27,83■■■□□ 2,05
Mtmr3Q8K296 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,83■■■□□ 2,05
Mtmr3Q8K296 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Mtmr3Q8K296 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Mtmr3Q8K296 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Mtmr3Q8K296 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Mtmr3Q8K296 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Mtmr3Q8K296 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Mtmr3Q8K296 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Mtmr3Q8K296 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Mtmr3Q8K296 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Mtmr3Q8K296 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27,77■■■□□ 2,04
Mtmr3Q8K296 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27,76■■■□□ 2,04
Mtmr3Q8K296 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Mtmr3Q8K296 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,76■■■□□ 2,03
Mtmr3Q8K296 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
Mtmr3Q8K296 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27,74■■■□□ 2,03
Mtmr3Q8K296 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27,74■■■□□ 2,03
Mtmr3Q8K296 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
Mtmr3Q8K296 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Mtmr3Q8K296 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Mtmr3Q8K296 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Mtmr3Q8K296 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Mtmr3Q8K296 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Mtmr3Q8K296 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,71■■■□□ 2,03
Mtmr3Q8K296 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Mtmr3Q8K296 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Mtmr3Q8K296 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Mtmr3Q8K296 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
Mtmr3Q8K296 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27,66■■■□□ 2,02
Mtmr3Q8K296 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Mtmr3Q8K296 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27,65■■■□□ 2,02
Mtmr3Q8K296 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Mtmr3Q8K296 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27,62■■■□□ 2,01
Mtmr3Q8K296 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27,62■■■□□ 2,01
Mtmr3Q8K296 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,62■■■□□ 2,01
Mtmr3Q8K296 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Mtmr3Q8K296 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Mtmr3Q8K296 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27,61■■■□□ 2,01
Mtmr3Q8K296 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,61■■■□□ 2,01
Mtmr3Q8K296 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Mtmr3Q8K296 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Mtmr3Q8K296 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Mtmr3Q8K296 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Mtmr3Q8K296 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27,6■■■□□ 2,01
Mtmr3Q8K296 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Mtmr3Q8K296 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Mtmr3Q8K296 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Mtmr3Q8K296 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27,58■■■□□ 2,01
Mtmr3Q8K296 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Mtmr3Q8K296 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,56■■■□□ 2
Mtmr3Q8K296 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Mtmr3Q8K296 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Mtmr3Q8K296 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Mtmr3Q8K296 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Mtmr3Q8K296 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27,54■■■□□ 2
Mtmr3Q8K296 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Mtmr3Q8K296 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Mtmr3Q8K296 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Mtmr3Q8K296 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,52■■■□□ 2
Mtmr3Q8K296 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Mtmr3Q8K296 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Mtmr3Q8K296 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27,52■■■□□ 2
Mtmr3Q8K296 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,51■■■□□ 2
Mtmr3Q8K296 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27,51■■□□□ 1,99
Mtmr3Q8K296 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
Mtmr3Q8K296 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
Mtmr3Q8K296 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
Mtmr3Q8K296 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
Mtmr3Q8K296 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Mtmr3Q8K296 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Mtmr3Q8K296 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Mtmr3Q8K296 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27,49■■□□□ 1,99
Mtmr3Q8K296 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27,48■■□□□ 1,99
Mtmr3Q8K296 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27,47■■□□□ 1,99
Mtmr3Q8K296 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27,47■■□□□ 1,99
Mtmr3Q8K296 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Mtmr3Q8K296 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,46■■□□□ 1,99
Mtmr3Q8K296 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms