Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1B8

Fermt3, Fermitin family homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fermt3Q8K1B8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fermt3Q8K1B8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fermt3Q8K1B8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Fermt3Q8K1B8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fermt3Q8K1B8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fermt3Q8K1B8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Fermt3Q8K1B8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fermt3Q8K1B8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Fermt3Q8K1B8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fermt3Q8K1B8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fermt3Q8K1B8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fermt3Q8K1B8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fermt3Q8K1B8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fermt3Q8K1B8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fermt3Q8K1B8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fermt3Q8K1B8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fermt3Q8K1B8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fermt3Q8K1B8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fermt3Q8K1B8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fermt3Q8K1B8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fermt3Q8K1B8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fermt3Q8K1B8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Fermt3Q8K1B8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fermt3Q8K1B8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fermt3Q8K1B8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fermt3Q8K1B8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fermt3Q8K1B8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fermt3Q8K1B8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fermt3Q8K1B8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fermt3Q8K1B8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fermt3Q8K1B8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fermt3Q8K1B8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fermt3Q8K1B8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fermt3Q8K1B8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fermt3Q8K1B8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fermt3Q8K1B8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fermt3Q8K1B8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fermt3Q8K1B8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fermt3Q8K1B8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fermt3Q8K1B8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fermt3Q8K1B8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fermt3Q8K1B8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fermt3Q8K1B8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fermt3Q8K1B8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fermt3Q8K1B8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fermt3Q8K1B8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fermt3Q8K1B8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fermt3Q8K1B8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fermt3Q8K1B8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Fermt3Q8K1B8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fermt3Q8K1B8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fermt3Q8K1B8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fermt3Q8K1B8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fermt3Q8K1B8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fermt3Q8K1B8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fermt3Q8K1B8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fermt3Q8K1B8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fermt3Q8K1B8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fermt3Q8K1B8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fermt3Q8K1B8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fermt3Q8K1B8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fermt3Q8K1B8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fermt3Q8K1B8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fermt3Q8K1B8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fermt3Q8K1B8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fermt3Q8K1B8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fermt3Q8K1B8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fermt3Q8K1B8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fermt3Q8K1B8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fermt3Q8K1B8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fermt3Q8K1B8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fermt3Q8K1B8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fermt3Q8K1B8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fermt3Q8K1B8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fermt3Q8K1B8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fermt3Q8K1B8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fermt3Q8K1B8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fermt3Q8K1B8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fermt3Q8K1B8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fermt3Q8K1B8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fermt3Q8K1B8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Fermt3Q8K1B8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fermt3Q8K1B8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fermt3Q8K1B8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fermt3Q8K1B8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fermt3Q8K1B8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fermt3Q8K1B8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fermt3Q8K1B8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fermt3Q8K1B8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fermt3Q8K1B8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fermt3Q8K1B8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fermt3Q8K1B8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fermt3Q8K1B8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fermt3Q8K1B8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fermt3Q8K1B8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fermt3Q8K1B8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fermt3Q8K1B8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Fermt3Q8K1B8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fermt3Q8K1B8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fermt3Q8K1B8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms