Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pkn3Q8K045 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pkn3Q8K045 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pkn3Q8K045 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pkn3Q8K045 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pkn3Q8K045 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pkn3Q8K045 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pkn3Q8K045 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pkn3Q8K045 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pkn3Q8K045 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pkn3Q8K045 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pkn3Q8K045 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pkn3Q8K045 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pkn3Q8K045 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pkn3Q8K045 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pkn3Q8K045 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pkn3Q8K045 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pkn3Q8K045 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pkn3Q8K045 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pkn3Q8K045 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pkn3Q8K045 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pkn3Q8K045 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pkn3Q8K045 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pkn3Q8K045 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pkn3Q8K045 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pkn3Q8K045 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pkn3Q8K045 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Pkn3Q8K045 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pkn3Q8K045 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pkn3Q8K045 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pkn3Q8K045 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pkn3Q8K045 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Pkn3Q8K045 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pkn3Q8K045 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pkn3Q8K045 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pkn3Q8K045 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pkn3Q8K045 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pkn3Q8K045 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pkn3Q8K045 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pkn3Q8K045 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pkn3Q8K045 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pkn3Q8K045 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pkn3Q8K045 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pkn3Q8K045 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pkn3Q8K045 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pkn3Q8K045 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pkn3Q8K045 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pkn3Q8K045 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pkn3Q8K045 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pkn3Q8K045 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pkn3Q8K045 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pkn3Q8K045 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pkn3Q8K045 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pkn3Q8K045 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pkn3Q8K045 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pkn3Q8K045 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pkn3Q8K045 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pkn3Q8K045 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pkn3Q8K045 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pkn3Q8K045 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pkn3Q8K045 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pkn3Q8K045 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pkn3Q8K045 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pkn3Q8K045 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pkn3Q8K045 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pkn3Q8K045 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pkn3Q8K045 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pkn3Q8K045 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pkn3Q8K045 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pkn3Q8K045 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pkn3Q8K045 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pkn3Q8K045 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pkn3Q8K045 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pkn3Q8K045 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pkn3Q8K045 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pkn3Q8K045 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pkn3Q8K045 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pkn3Q8K045 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pkn3Q8K045 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pkn3Q8K045 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pkn3Q8K045 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pkn3Q8K045 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pkn3Q8K045 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Pkn3Q8K045 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pkn3Q8K045 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Pkn3Q8K045 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pkn3Q8K045 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Pkn3Q8K045 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pkn3Q8K045 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pkn3Q8K045 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pkn3Q8K045 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pkn3Q8K045 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pkn3Q8K045 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pkn3Q8K045 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pkn3Q8K045 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pkn3Q8K045 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pkn3Q8K045 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pkn3Q8K045 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pkn3Q8K045 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pkn3Q8K045 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms