Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZS0

Lin7a, Protein lin-7 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin7aQ8JZS0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lin7aQ8JZS0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lin7aQ8JZS0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lin7aQ8JZS0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lin7aQ8JZS0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lin7aQ8JZS0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lin7aQ8JZS0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lin7aQ8JZS0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lin7aQ8JZS0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lin7aQ8JZS0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Lin7aQ8JZS0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lin7aQ8JZS0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lin7aQ8JZS0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lin7aQ8JZS0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lin7aQ8JZS0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lin7aQ8JZS0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lin7aQ8JZS0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lin7aQ8JZS0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lin7aQ8JZS0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lin7aQ8JZS0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lin7aQ8JZS0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lin7aQ8JZS0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lin7aQ8JZS0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lin7aQ8JZS0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lin7aQ8JZS0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lin7aQ8JZS0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Lin7aQ8JZS0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lin7aQ8JZS0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lin7aQ8JZS0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lin7aQ8JZS0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lin7aQ8JZS0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lin7aQ8JZS0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lin7aQ8JZS0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lin7aQ8JZS0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lin7aQ8JZS0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lin7aQ8JZS0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lin7aQ8JZS0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lin7aQ8JZS0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Lin7aQ8JZS0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lin7aQ8JZS0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lin7aQ8JZS0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lin7aQ8JZS0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lin7aQ8JZS0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lin7aQ8JZS0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lin7aQ8JZS0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lin7aQ8JZS0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lin7aQ8JZS0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lin7aQ8JZS0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lin7aQ8JZS0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lin7aQ8JZS0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lin7aQ8JZS0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lin7aQ8JZS0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lin7aQ8JZS0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lin7aQ8JZS0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lin7aQ8JZS0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lin7aQ8JZS0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lin7aQ8JZS0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lin7aQ8JZS0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lin7aQ8JZS0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lin7aQ8JZS0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lin7aQ8JZS0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lin7aQ8JZS0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lin7aQ8JZS0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lin7aQ8JZS0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lin7aQ8JZS0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lin7aQ8JZS0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Lin7aQ8JZS0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lin7aQ8JZS0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Lin7aQ8JZS0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lin7aQ8JZS0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lin7aQ8JZS0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lin7aQ8JZS0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lin7aQ8JZS0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lin7aQ8JZS0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lin7aQ8JZS0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lin7aQ8JZS0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lin7aQ8JZS0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lin7aQ8JZS0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lin7aQ8JZS0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lin7aQ8JZS0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lin7aQ8JZS0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lin7aQ8JZS0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lin7aQ8JZS0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lin7aQ8JZS0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lin7aQ8JZS0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lin7aQ8JZS0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lin7aQ8JZS0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lin7aQ8JZS0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lin7aQ8JZS0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lin7aQ8JZS0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lin7aQ8JZS0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lin7aQ8JZS0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lin7aQ8JZS0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lin7aQ8JZS0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lin7aQ8JZS0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lin7aQ8JZS0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lin7aQ8JZS0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lin7aQ8JZS0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lin7aQ8JZS0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lin7aQ8JZS0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms