Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZQ2

Afg3l2, AFG3-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l2Q8JZQ2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Afg3l2Q8JZQ2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Afg3l2Q8JZQ2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Afg3l2Q8JZQ2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Afg3l2Q8JZQ2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Afg3l2Q8JZQ2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Afg3l2Q8JZQ2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Afg3l2Q8JZQ2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Afg3l2Q8JZQ2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Afg3l2Q8JZQ2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
Afg3l2Q8JZQ2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Afg3l2Q8JZQ2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Afg3l2Q8JZQ2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Afg3l2Q8JZQ2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Afg3l2Q8JZQ2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Afg3l2Q8JZQ2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Afg3l2Q8JZQ2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Afg3l2Q8JZQ2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Afg3l2Q8JZQ2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Afg3l2Q8JZQ2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Afg3l2Q8JZQ2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
Afg3l2Q8JZQ2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Afg3l2Q8JZQ2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Afg3l2Q8JZQ2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Afg3l2Q8JZQ2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Afg3l2Q8JZQ2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Afg3l2Q8JZQ2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Afg3l2Q8JZQ2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
Afg3l2Q8JZQ2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Afg3l2Q8JZQ2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Afg3l2Q8JZQ2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Afg3l2Q8JZQ2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Afg3l2Q8JZQ2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Afg3l2Q8JZQ2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Afg3l2Q8JZQ2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Afg3l2Q8JZQ2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Afg3l2Q8JZQ2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Afg3l2Q8JZQ2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Afg3l2Q8JZQ2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Afg3l2Q8JZQ2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Afg3l2Q8JZQ2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Afg3l2Q8JZQ2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Afg3l2Q8JZQ2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Afg3l2Q8JZQ2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Afg3l2Q8JZQ2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Afg3l2Q8JZQ2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Afg3l2Q8JZQ2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
Afg3l2Q8JZQ2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Afg3l2Q8JZQ2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Afg3l2Q8JZQ2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Afg3l2Q8JZQ2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Afg3l2Q8JZQ2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Afg3l2Q8JZQ2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Afg3l2Q8JZQ2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Afg3l2Q8JZQ2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Afg3l2Q8JZQ2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Afg3l2Q8JZQ2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Afg3l2Q8JZQ2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Afg3l2Q8JZQ2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Afg3l2Q8JZQ2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Afg3l2Q8JZQ2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Afg3l2Q8JZQ2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Afg3l2Q8JZQ2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Afg3l2Q8JZQ2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Afg3l2Q8JZQ2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Afg3l2Q8JZQ2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Afg3l2Q8JZQ2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
Afg3l2Q8JZQ2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Afg3l2Q8JZQ2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Afg3l2Q8JZQ2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Afg3l2Q8JZQ2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Afg3l2Q8JZQ2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Afg3l2Q8JZQ2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Afg3l2Q8JZQ2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Afg3l2Q8JZQ2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Afg3l2Q8JZQ2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Afg3l2Q8JZQ2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Afg3l2Q8JZQ2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Afg3l2Q8JZQ2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Afg3l2Q8JZQ2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Afg3l2Q8JZQ2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Afg3l2Q8JZQ2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Afg3l2Q8JZQ2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Afg3l2Q8JZQ2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Afg3l2Q8JZQ2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Afg3l2Q8JZQ2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Afg3l2Q8JZQ2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Afg3l2Q8JZQ2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
Afg3l2Q8JZQ2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Afg3l2Q8JZQ2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Afg3l2Q8JZQ2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Afg3l2Q8JZQ2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Afg3l2Q8JZQ2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Afg3l2Q8JZQ2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Afg3l2Q8JZQ2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Afg3l2Q8JZQ2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Afg3l2Q8JZQ2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Afg3l2Q8JZQ2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Afg3l2Q8JZQ2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Afg3l2Q8JZQ2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms