Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trip10Q8CJ53 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trip10Q8CJ53 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trip10Q8CJ53 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trip10Q8CJ53 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trip10Q8CJ53 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trip10Q8CJ53 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trip10Q8CJ53 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trip10Q8CJ53 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trip10Q8CJ53 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trip10Q8CJ53 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trip10Q8CJ53 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trip10Q8CJ53 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trip10Q8CJ53 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trip10Q8CJ53 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trip10Q8CJ53 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Trip10Q8CJ53 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trip10Q8CJ53 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trip10Q8CJ53 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trip10Q8CJ53 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Trip10Q8CJ53 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Trip10Q8CJ53 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trip10Q8CJ53 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trip10Q8CJ53 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Trip10Q8CJ53 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Trip10Q8CJ53 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Trip10Q8CJ53 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trip10Q8CJ53 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trip10Q8CJ53 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trip10Q8CJ53 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trip10Q8CJ53 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trip10Q8CJ53 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trip10Q8CJ53 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trip10Q8CJ53 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trip10Q8CJ53 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trip10Q8CJ53 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trip10Q8CJ53 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trip10Q8CJ53 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trip10Q8CJ53 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trip10Q8CJ53 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trip10Q8CJ53 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trip10Q8CJ53 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trip10Q8CJ53 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trip10Q8CJ53 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trip10Q8CJ53 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trip10Q8CJ53 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trip10Q8CJ53 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trip10Q8CJ53 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trip10Q8CJ53 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trip10Q8CJ53 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trip10Q8CJ53 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trip10Q8CJ53 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trip10Q8CJ53 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trip10Q8CJ53 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trip10Q8CJ53 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trip10Q8CJ53 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trip10Q8CJ53 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trip10Q8CJ53 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trip10Q8CJ53 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trip10Q8CJ53 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trip10Q8CJ53 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trip10Q8CJ53 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trip10Q8CJ53 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trip10Q8CJ53 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trip10Q8CJ53 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trip10Q8CJ53 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trip10Q8CJ53 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trip10Q8CJ53 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trip10Q8CJ53 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trip10Q8CJ53 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trip10Q8CJ53 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trip10Q8CJ53 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trip10Q8CJ53 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trip10Q8CJ53 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trip10Q8CJ53 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trip10Q8CJ53 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trip10Q8CJ53 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trip10Q8CJ53 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trip10Q8CJ53 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trip10Q8CJ53 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trip10Q8CJ53 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trip10Q8CJ53 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trip10Q8CJ53 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trip10Q8CJ53 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trip10Q8CJ53 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Trip10Q8CJ53 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trip10Q8CJ53 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trip10Q8CJ53 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trip10Q8CJ53 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trip10Q8CJ53 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trip10Q8CJ53 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trip10Q8CJ53 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trip10Q8CJ53 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trip10Q8CJ53 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trip10Q8CJ53 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trip10Q8CJ53 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trip10Q8CJ53 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trip10Q8CJ53 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trip10Q8CJ53 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trip10Q8CJ53 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms