Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIB9

Esco2, N-acetyltransferase ESCO2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Esco2Q8CIB9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Esco2Q8CIB9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Esco2Q8CIB9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Esco2Q8CIB9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Esco2Q8CIB9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Esco2Q8CIB9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Esco2Q8CIB9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Esco2Q8CIB9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Esco2Q8CIB9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Esco2Q8CIB9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Esco2Q8CIB9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Esco2Q8CIB9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Esco2Q8CIB9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Esco2Q8CIB9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Esco2Q8CIB9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Esco2Q8CIB9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Esco2Q8CIB9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Esco2Q8CIB9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Esco2Q8CIB9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Esco2Q8CIB9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Esco2Q8CIB9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Esco2Q8CIB9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Esco2Q8CIB9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Esco2Q8CIB9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Esco2Q8CIB9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Esco2Q8CIB9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Esco2Q8CIB9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Esco2Q8CIB9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Esco2Q8CIB9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Esco2Q8CIB9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Esco2Q8CIB9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Esco2Q8CIB9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Esco2Q8CIB9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Esco2Q8CIB9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Esco2Q8CIB9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Esco2Q8CIB9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Esco2Q8CIB9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Esco2Q8CIB9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Esco2Q8CIB9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Esco2Q8CIB9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Esco2Q8CIB9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Esco2Q8CIB9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Esco2Q8CIB9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Esco2Q8CIB9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Esco2Q8CIB9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Esco2Q8CIB9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Esco2Q8CIB9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Esco2Q8CIB9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Esco2Q8CIB9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Esco2Q8CIB9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Esco2Q8CIB9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Esco2Q8CIB9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Esco2Q8CIB9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Esco2Q8CIB9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Esco2Q8CIB9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Esco2Q8CIB9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Esco2Q8CIB9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Esco2Q8CIB9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Esco2Q8CIB9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Esco2Q8CIB9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Esco2Q8CIB9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Esco2Q8CIB9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Esco2Q8CIB9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Esco2Q8CIB9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Esco2Q8CIB9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Esco2Q8CIB9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Esco2Q8CIB9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Esco2Q8CIB9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Esco2Q8CIB9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Esco2Q8CIB9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Esco2Q8CIB9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Esco2Q8CIB9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Esco2Q8CIB9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Esco2Q8CIB9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Esco2Q8CIB9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Esco2Q8CIB9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Esco2Q8CIB9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Esco2Q8CIB9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Esco2Q8CIB9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Esco2Q8CIB9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Esco2Q8CIB9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Esco2Q8CIB9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Esco2Q8CIB9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Esco2Q8CIB9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Esco2Q8CIB9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Esco2Q8CIB9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Esco2Q8CIB9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Esco2Q8CIB9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Esco2Q8CIB9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Esco2Q8CIB9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Esco2Q8CIB9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Esco2Q8CIB9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Esco2Q8CIB9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Esco2Q8CIB9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Esco2Q8CIB9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Esco2Q8CIB9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Esco2Q8CIB9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Esco2Q8CIB9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Esco2Q8CIB9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Esco2Q8CIB9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms