Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGK6

Ifnl3, Interferon lambda-3, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnl3Q8CGK6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ifnl3Q8CGK6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ifnl3Q8CGK6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ifnl3Q8CGK6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ifnl3Q8CGK6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ifnl3Q8CGK6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ifnl3Q8CGK6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ifnl3Q8CGK6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ifnl3Q8CGK6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ifnl3Q8CGK6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ifnl3Q8CGK6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ifnl3Q8CGK6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ifnl3Q8CGK6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ifnl3Q8CGK6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ifnl3Q8CGK6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ifnl3Q8CGK6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ifnl3Q8CGK6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ifnl3Q8CGK6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ifnl3Q8CGK6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ifnl3Q8CGK6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ifnl3Q8CGK6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ifnl3Q8CGK6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ifnl3Q8CGK6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ifnl3Q8CGK6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ifnl3Q8CGK6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ifnl3Q8CGK6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ifnl3Q8CGK6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ifnl3Q8CGK6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ifnl3Q8CGK6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ifnl3Q8CGK6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ifnl3Q8CGK6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ifnl3Q8CGK6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ifnl3Q8CGK6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ifnl3Q8CGK6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ifnl3Q8CGK6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ifnl3Q8CGK6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ifnl3Q8CGK6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ifnl3Q8CGK6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ifnl3Q8CGK6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ifnl3Q8CGK6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ifnl3Q8CGK6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ifnl3Q8CGK6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ifnl3Q8CGK6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ifnl3Q8CGK6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ifnl3Q8CGK6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ifnl3Q8CGK6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ifnl3Q8CGK6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ifnl3Q8CGK6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ifnl3Q8CGK6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ifnl3Q8CGK6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ifnl3Q8CGK6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ifnl3Q8CGK6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ifnl3Q8CGK6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ifnl3Q8CGK6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ifnl3Q8CGK6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ifnl3Q8CGK6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ifnl3Q8CGK6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ifnl3Q8CGK6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ifnl3Q8CGK6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ifnl3Q8CGK6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ifnl3Q8CGK6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ifnl3Q8CGK6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ifnl3Q8CGK6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ifnl3Q8CGK6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ifnl3Q8CGK6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ifnl3Q8CGK6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ifnl3Q8CGK6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ifnl3Q8CGK6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ifnl3Q8CGK6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ifnl3Q8CGK6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ifnl3Q8CGK6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ifnl3Q8CGK6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ifnl3Q8CGK6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ifnl3Q8CGK6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ifnl3Q8CGK6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ifnl3Q8CGK6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ifnl3Q8CGK6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ifnl3Q8CGK6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ifnl3Q8CGK6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ifnl3Q8CGK6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ifnl3Q8CGK6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ifnl3Q8CGK6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ifnl3Q8CGK6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ifnl3Q8CGK6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ifnl3Q8CGK6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ifnl3Q8CGK6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ifnl3Q8CGK6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ifnl3Q8CGK6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ifnl3Q8CGK6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ifnl3Q8CGK6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ifnl3Q8CGK6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ifnl3Q8CGK6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ifnl3Q8CGK6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ifnl3Q8CGK6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ifnl3Q8CGK6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ifnl3Q8CGK6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ifnl3Q8CGK6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ifnl3Q8CGK6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ifnl3Q8CGK6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ifnl3Q8CGK6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms