Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFW7

Cc2d2a, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cc2d2aQ8CFW7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.01■■■■■ 4.64
Cc2d2aQ8CFW7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC44.01■■■■■ 4.64
Cc2d2aQ8CFW7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.01■■■■■ 4.64
Cc2d2aQ8CFW7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC44.01■■■■■ 4.64
Cc2d2aQ8CFW7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.01■■■■■ 4.64
Cc2d2aQ8CFW7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.01■■■■■ 4.64
Cc2d2aQ8CFW7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
Cc2d2aQ8CFW7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC44■■■■■ 4.63
Cc2d2aQ8CFW7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
Cc2d2aQ8CFW7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC43.99■■■■■ 4.63
Cc2d2aQ8CFW7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC43.99■■■■■ 4.63
Cc2d2aQ8CFW7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
Cc2d2aQ8CFW7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
Cc2d2aQ8CFW7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
Cc2d2aQ8CFW7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
Cc2d2aQ8CFW7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC43.91■■■■■ 4.62
Cc2d2aQ8CFW7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
Cc2d2aQ8CFW7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC43.89■■■■■ 4.62
Cc2d2aQ8CFW7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC43.89■■■■■ 4.62
Cc2d2aQ8CFW7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC43.89■■■■■ 4.62
Cc2d2aQ8CFW7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC43.89■■■■■ 4.62
Cc2d2aQ8CFW7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC43.89■■■■■ 4.62
Cc2d2aQ8CFW7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC43.89■■■■■ 4.62
Cc2d2aQ8CFW7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC43.87■■■■■ 4.61
Cc2d2aQ8CFW7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.86■■■■■ 4.61
Cc2d2aQ8CFW7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC43.85■■■■■ 4.61
Cc2d2aQ8CFW7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
Cc2d2aQ8CFW7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
Cc2d2aQ8CFW7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
Cc2d2aQ8CFW7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
Cc2d2aQ8CFW7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.61
Cc2d2aQ8CFW7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.61
Cc2d2aQ8CFW7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
Cc2d2aQ8CFW7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC43.81■■■■■ 4.6
Cc2d2aQ8CFW7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.81■■■■■ 4.6
Cc2d2aQ8CFW7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
Cc2d2aQ8CFW7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC43.81■■■■■ 4.6
Cc2d2aQ8CFW7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
Cc2d2aQ8CFW7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC43.79■■■■■ 4.6
Cc2d2aQ8CFW7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.77■■■■■ 4.6
Cc2d2aQ8CFW7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC43.76■■■■■ 4.6
Cc2d2aQ8CFW7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
Cc2d2aQ8CFW7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
Cc2d2aQ8CFW7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
Cc2d2aQ8CFW7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
Cc2d2aQ8CFW7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
Cc2d2aQ8CFW7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
Cc2d2aQ8CFW7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC43.73■■■■■ 4.59
Cc2d2aQ8CFW7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
Cc2d2aQ8CFW7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
Cc2d2aQ8CFW7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.58
Cc2d2aQ8CFW7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
Cc2d2aQ8CFW7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
Cc2d2aQ8CFW7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
Cc2d2aQ8CFW7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
Cc2d2aQ8CFW7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
Cc2d2aQ8CFW7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
Cc2d2aQ8CFW7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
Cc2d2aQ8CFW7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
Cc2d2aQ8CFW7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC43.63■■■■■ 4.58
Cc2d2aQ8CFW7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.57
Cc2d2aQ8CFW7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC43.62■■■■■ 4.57
Cc2d2aQ8CFW7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
Cc2d2aQ8CFW7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.61■■■■■ 4.57
Cc2d2aQ8CFW7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC43.6■■■■■ 4.57
Cc2d2aQ8CFW7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
Cc2d2aQ8CFW7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
Cc2d2aQ8CFW7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
Cc2d2aQ8CFW7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC43.57■■■■■ 4.57
Cc2d2aQ8CFW7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC43.57■■■■■ 4.57
Cc2d2aQ8CFW7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
Cc2d2aQ8CFW7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
Cc2d2aQ8CFW7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC43.54■■■■■ 4.56
Cc2d2aQ8CFW7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC43.51■■■■■ 4.56
Cc2d2aQ8CFW7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC43.51■■■■■ 4.56
Cc2d2aQ8CFW7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
Cc2d2aQ8CFW7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
Cc2d2aQ8CFW7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
Cc2d2aQ8CFW7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC43.48■■■■■ 4.55
Cc2d2aQ8CFW7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC43.48■■■■■ 4.55
Cc2d2aQ8CFW7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
Cc2d2aQ8CFW7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
Cc2d2aQ8CFW7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
Cc2d2aQ8CFW7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
Cc2d2aQ8CFW7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
Cc2d2aQ8CFW7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
Cc2d2aQ8CFW7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC43.41■■■■■ 4.54
Cc2d2aQ8CFW7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
Cc2d2aQ8CFW7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
Cc2d2aQ8CFW7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
Cc2d2aQ8CFW7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC43.39■■■■■ 4.54
Cc2d2aQ8CFW7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC43.38■■■■■ 4.54
Cc2d2aQ8CFW7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.53
Cc2d2aQ8CFW7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC43.37■■■■■ 4.53
Cc2d2aQ8CFW7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC43.36■■■■■ 4.53
Cc2d2aQ8CFW7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
Cc2d2aQ8CFW7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
Cc2d2aQ8CFW7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
Cc2d2aQ8CFW7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.34■■■■■ 4.53
Cc2d2aQ8CFW7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms