Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nup88Q8CEC0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nup88Q8CEC0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nup88Q8CEC0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nup88Q8CEC0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Nup88Q8CEC0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nup88Q8CEC0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nup88Q8CEC0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nup88Q8CEC0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nup88Q8CEC0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Nup88Q8CEC0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nup88Q8CEC0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nup88Q8CEC0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nup88Q8CEC0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nup88Q8CEC0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nup88Q8CEC0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nup88Q8CEC0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nup88Q8CEC0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nup88Q8CEC0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nup88Q8CEC0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Nup88Q8CEC0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Nup88Q8CEC0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Nup88Q8CEC0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nup88Q8CEC0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nup88Q8CEC0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nup88Q8CEC0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nup88Q8CEC0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nup88Q8CEC0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nup88Q8CEC0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Nup88Q8CEC0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nup88Q8CEC0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nup88Q8CEC0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nup88Q8CEC0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nup88Q8CEC0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nup88Q8CEC0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nup88Q8CEC0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Nup88Q8CEC0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nup88Q8CEC0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nup88Q8CEC0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Nup88Q8CEC0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nup88Q8CEC0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nup88Q8CEC0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nup88Q8CEC0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nup88Q8CEC0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nup88Q8CEC0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Nup88Q8CEC0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nup88Q8CEC0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Nup88Q8CEC0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nup88Q8CEC0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nup88Q8CEC0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nup88Q8CEC0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nup88Q8CEC0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nup88Q8CEC0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nup88Q8CEC0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nup88Q8CEC0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nup88Q8CEC0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Nup88Q8CEC0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nup88Q8CEC0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nup88Q8CEC0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nup88Q8CEC0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nup88Q8CEC0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nup88Q8CEC0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nup88Q8CEC0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nup88Q8CEC0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nup88Q8CEC0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nup88Q8CEC0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nup88Q8CEC0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nup88Q8CEC0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nup88Q8CEC0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nup88Q8CEC0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Nup88Q8CEC0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nup88Q8CEC0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nup88Q8CEC0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nup88Q8CEC0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nup88Q8CEC0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nup88Q8CEC0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nup88Q8CEC0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Nup88Q8CEC0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Nup88Q8CEC0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Nup88Q8CEC0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Nup88Q8CEC0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Nup88Q8CEC0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nup88Q8CEC0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Nup88Q8CEC0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Nup88Q8CEC0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nup88Q8CEC0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nup88Q8CEC0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nup88Q8CEC0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nup88Q8CEC0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nup88Q8CEC0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nup88Q8CEC0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nup88Q8CEC0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nup88Q8CEC0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Nup88Q8CEC0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nup88Q8CEC0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nup88Q8CEC0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nup88Q8CEC0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nup88Q8CEC0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nup88Q8CEC0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nup88Q8CEC0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms