Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nhlrc3Q8CCH2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nhlrc3Q8CCH2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nhlrc3Q8CCH2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nhlrc3Q8CCH2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nhlrc3Q8CCH2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nhlrc3Q8CCH2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nhlrc3Q8CCH2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nhlrc3Q8CCH2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nhlrc3Q8CCH2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Nhlrc3Q8CCH2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nhlrc3Q8CCH2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nhlrc3Q8CCH2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nhlrc3Q8CCH2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nhlrc3Q8CCH2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nhlrc3Q8CCH2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms