Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ephb1Q8CBF3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ephb1Q8CBF3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ephb1Q8CBF3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ephb1Q8CBF3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ephb1Q8CBF3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ephb1Q8CBF3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Ephb1Q8CBF3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ephb1Q8CBF3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ephb1Q8CBF3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ephb1Q8CBF3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ephb1Q8CBF3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ephb1Q8CBF3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ephb1Q8CBF3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ephb1Q8CBF3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ephb1Q8CBF3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ephb1Q8CBF3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ephb1Q8CBF3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ephb1Q8CBF3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ephb1Q8CBF3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ephb1Q8CBF3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ephb1Q8CBF3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ephb1Q8CBF3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ephb1Q8CBF3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ephb1Q8CBF3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ephb1Q8CBF3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ephb1Q8CBF3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ephb1Q8CBF3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ephb1Q8CBF3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ephb1Q8CBF3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ephb1Q8CBF3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ephb1Q8CBF3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ephb1Q8CBF3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ephb1Q8CBF3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ephb1Q8CBF3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ephb1Q8CBF3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ephb1Q8CBF3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ephb1Q8CBF3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ephb1Q8CBF3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ephb1Q8CBF3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ephb1Q8CBF3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ephb1Q8CBF3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ephb1Q8CBF3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ephb1Q8CBF3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ephb1Q8CBF3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ephb1Q8CBF3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ephb1Q8CBF3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ephb1Q8CBF3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ephb1Q8CBF3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ephb1Q8CBF3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ephb1Q8CBF3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ephb1Q8CBF3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ephb1Q8CBF3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ephb1Q8CBF3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ephb1Q8CBF3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ephb1Q8CBF3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ephb1Q8CBF3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ephb1Q8CBF3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ephb1Q8CBF3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ephb1Q8CBF3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ephb1Q8CBF3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ephb1Q8CBF3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ephb1Q8CBF3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ephb1Q8CBF3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ephb1Q8CBF3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ephb1Q8CBF3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ephb1Q8CBF3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ephb1Q8CBF3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ephb1Q8CBF3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ephb1Q8CBF3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ephb1Q8CBF3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Ephb1Q8CBF3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ephb1Q8CBF3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ephb1Q8CBF3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ephb1Q8CBF3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ephb1Q8CBF3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ephb1Q8CBF3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ephb1Q8CBF3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ephb1Q8CBF3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ephb1Q8CBF3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ephb1Q8CBF3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ephb1Q8CBF3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ephb1Q8CBF3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ephb1Q8CBF3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ephb1Q8CBF3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ephb1Q8CBF3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ephb1Q8CBF3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ephb1Q8CBF3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ephb1Q8CBF3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ephb1Q8CBF3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ephb1Q8CBF3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ephb1Q8CBF3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ephb1Q8CBF3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ephb1Q8CBF3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ephb1Q8CBF3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ephb1Q8CBF3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ephb1Q8CBF3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ephb1Q8CBF3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ephb1Q8CBF3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ephb1Q8CBF3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
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