Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hdac7Q8C2B3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hdac7Q8C2B3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Hdac7Q8C2B3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hdac7Q8C2B3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hdac7Q8C2B3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hdac7Q8C2B3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hdac7Q8C2B3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hdac7Q8C2B3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Hdac7Q8C2B3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hdac7Q8C2B3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hdac7Q8C2B3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hdac7Q8C2B3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hdac7Q8C2B3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hdac7Q8C2B3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hdac7Q8C2B3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hdac7Q8C2B3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hdac7Q8C2B3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Hdac7Q8C2B3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hdac7Q8C2B3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hdac7Q8C2B3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hdac7Q8C2B3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hdac7Q8C2B3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hdac7Q8C2B3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hdac7Q8C2B3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hdac7Q8C2B3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hdac7Q8C2B3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hdac7Q8C2B3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hdac7Q8C2B3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hdac7Q8C2B3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Hdac7Q8C2B3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hdac7Q8C2B3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hdac7Q8C2B3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Hdac7Q8C2B3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hdac7Q8C2B3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hdac7Q8C2B3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hdac7Q8C2B3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Hdac7Q8C2B3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hdac7Q8C2B3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hdac7Q8C2B3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hdac7Q8C2B3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hdac7Q8C2B3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hdac7Q8C2B3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hdac7Q8C2B3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hdac7Q8C2B3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hdac7Q8C2B3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hdac7Q8C2B3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Hdac7Q8C2B3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Hdac7Q8C2B3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Hdac7Q8C2B3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hdac7Q8C2B3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hdac7Q8C2B3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hdac7Q8C2B3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hdac7Q8C2B3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hdac7Q8C2B3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Hdac7Q8C2B3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hdac7Q8C2B3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hdac7Q8C2B3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hdac7Q8C2B3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hdac7Q8C2B3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hdac7Q8C2B3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hdac7Q8C2B3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hdac7Q8C2B3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hdac7Q8C2B3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Hdac7Q8C2B3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hdac7Q8C2B3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hdac7Q8C2B3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hdac7Q8C2B3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hdac7Q8C2B3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hdac7Q8C2B3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hdac7Q8C2B3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hdac7Q8C2B3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hdac7Q8C2B3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Hdac7Q8C2B3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Hdac7Q8C2B3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hdac7Q8C2B3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hdac7Q8C2B3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hdac7Q8C2B3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Hdac7Q8C2B3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hdac7Q8C2B3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hdac7Q8C2B3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hdac7Q8C2B3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hdac7Q8C2B3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hdac7Q8C2B3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hdac7Q8C2B3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hdac7Q8C2B3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hdac7Q8C2B3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hdac7Q8C2B3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hdac7Q8C2B3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hdac7Q8C2B3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hdac7Q8C2B3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hdac7Q8C2B3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hdac7Q8C2B3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hdac7Q8C2B3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hdac7Q8C2B3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hdac7Q8C2B3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hdac7Q8C2B3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hdac7Q8C2B3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Hdac7Q8C2B3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hdac7Q8C2B3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
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