Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1N8

Defa22, Alpha-defensin 22, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa22Q8C1N8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Defa22Q8C1N8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Defa22Q8C1N8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Defa22Q8C1N8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Defa22Q8C1N8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Defa22Q8C1N8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Defa22Q8C1N8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Defa22Q8C1N8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Defa22Q8C1N8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Defa22Q8C1N8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Defa22Q8C1N8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Defa22Q8C1N8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Defa22Q8C1N8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Defa22Q8C1N8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Defa22Q8C1N8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Defa22Q8C1N8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Defa22Q8C1N8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Defa22Q8C1N8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Defa22Q8C1N8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Defa22Q8C1N8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Defa22Q8C1N8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Defa22Q8C1N8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Defa22Q8C1N8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Defa22Q8C1N8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Defa22Q8C1N8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Defa22Q8C1N8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Defa22Q8C1N8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Defa22Q8C1N8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Defa22Q8C1N8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Defa22Q8C1N8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Defa22Q8C1N8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Defa22Q8C1N8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Defa22Q8C1N8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Defa22Q8C1N8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Defa22Q8C1N8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Defa22Q8C1N8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Defa22Q8C1N8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Defa22Q8C1N8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Defa22Q8C1N8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Defa22Q8C1N8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Defa22Q8C1N8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Defa22Q8C1N8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Defa22Q8C1N8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Defa22Q8C1N8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Defa22Q8C1N8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Defa22Q8C1N8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Defa22Q8C1N8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Defa22Q8C1N8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Defa22Q8C1N8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Defa22Q8C1N8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Defa22Q8C1N8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Defa22Q8C1N8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Defa22Q8C1N8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Defa22Q8C1N8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Defa22Q8C1N8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Defa22Q8C1N8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Defa22Q8C1N8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Defa22Q8C1N8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Defa22Q8C1N8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Defa22Q8C1N8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Defa22Q8C1N8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Defa22Q8C1N8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Defa22Q8C1N8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Defa22Q8C1N8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Defa22Q8C1N8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Defa22Q8C1N8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Defa22Q8C1N8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Defa22Q8C1N8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Defa22Q8C1N8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Defa22Q8C1N8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Defa22Q8C1N8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Defa22Q8C1N8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Defa22Q8C1N8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Defa22Q8C1N8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Defa22Q8C1N8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Defa22Q8C1N8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Defa22Q8C1N8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Defa22Q8C1N8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Defa22Q8C1N8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Defa22Q8C1N8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Defa22Q8C1N8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Defa22Q8C1N8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Defa22Q8C1N8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Defa22Q8C1N8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Defa22Q8C1N8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Defa22Q8C1N8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Defa22Q8C1N8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Defa22Q8C1N8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Defa22Q8C1N8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Defa22Q8C1N8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Defa22Q8C1N8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Defa22Q8C1N8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Defa22Q8C1N8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Defa22Q8C1N8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Defa22Q8C1N8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Defa22Q8C1N8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Defa22Q8C1N8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Defa22Q8C1N8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Defa22Q8C1N8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Defa22Q8C1N8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms