Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J6

Sowahc, Ankyrin repeat domain-containing protein SOWAHC, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SowahcQ8C0J6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SowahcQ8C0J6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SowahcQ8C0J6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SowahcQ8C0J6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SowahcQ8C0J6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SowahcQ8C0J6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SowahcQ8C0J6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SowahcQ8C0J6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SowahcQ8C0J6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SowahcQ8C0J6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SowahcQ8C0J6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SowahcQ8C0J6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SowahcQ8C0J6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SowahcQ8C0J6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SowahcQ8C0J6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SowahcQ8C0J6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SowahcQ8C0J6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SowahcQ8C0J6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SowahcQ8C0J6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SowahcQ8C0J6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SowahcQ8C0J6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SowahcQ8C0J6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SowahcQ8C0J6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SowahcQ8C0J6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SowahcQ8C0J6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SowahcQ8C0J6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SowahcQ8C0J6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SowahcQ8C0J6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SowahcQ8C0J6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SowahcQ8C0J6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SowahcQ8C0J6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SowahcQ8C0J6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SowahcQ8C0J6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SowahcQ8C0J6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SowahcQ8C0J6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SowahcQ8C0J6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SowahcQ8C0J6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SowahcQ8C0J6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SowahcQ8C0J6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SowahcQ8C0J6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SowahcQ8C0J6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SowahcQ8C0J6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
SowahcQ8C0J6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SowahcQ8C0J6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SowahcQ8C0J6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SowahcQ8C0J6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SowahcQ8C0J6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SowahcQ8C0J6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SowahcQ8C0J6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SowahcQ8C0J6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SowahcQ8C0J6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SowahcQ8C0J6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SowahcQ8C0J6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SowahcQ8C0J6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SowahcQ8C0J6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SowahcQ8C0J6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SowahcQ8C0J6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SowahcQ8C0J6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SowahcQ8C0J6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SowahcQ8C0J6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SowahcQ8C0J6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SowahcQ8C0J6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SowahcQ8C0J6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SowahcQ8C0J6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SowahcQ8C0J6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SowahcQ8C0J6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SowahcQ8C0J6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SowahcQ8C0J6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SowahcQ8C0J6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SowahcQ8C0J6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SowahcQ8C0J6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SowahcQ8C0J6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SowahcQ8C0J6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SowahcQ8C0J6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SowahcQ8C0J6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
SowahcQ8C0J6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SowahcQ8C0J6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SowahcQ8C0J6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SowahcQ8C0J6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SowahcQ8C0J6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SowahcQ8C0J6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SowahcQ8C0J6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SowahcQ8C0J6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SowahcQ8C0J6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SowahcQ8C0J6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SowahcQ8C0J6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SowahcQ8C0J6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SowahcQ8C0J6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SowahcQ8C0J6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SowahcQ8C0J6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SowahcQ8C0J6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SowahcQ8C0J6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
SowahcQ8C0J6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SowahcQ8C0J6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SowahcQ8C0J6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SowahcQ8C0J6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SowahcQ8C0J6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SowahcQ8C0J6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SowahcQ8C0J6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SowahcQ8C0J6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms