Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA0

Lrfn5, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn5Q8BXA0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrfn5Q8BXA0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrfn5Q8BXA0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrfn5Q8BXA0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrfn5Q8BXA0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrfn5Q8BXA0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrfn5Q8BXA0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrfn5Q8BXA0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrfn5Q8BXA0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrfn5Q8BXA0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrfn5Q8BXA0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrfn5Q8BXA0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrfn5Q8BXA0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrfn5Q8BXA0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrfn5Q8BXA0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrfn5Q8BXA0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrfn5Q8BXA0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrfn5Q8BXA0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrfn5Q8BXA0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrfn5Q8BXA0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrfn5Q8BXA0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrfn5Q8BXA0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrfn5Q8BXA0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrfn5Q8BXA0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrfn5Q8BXA0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrfn5Q8BXA0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrfn5Q8BXA0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrfn5Q8BXA0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrfn5Q8BXA0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrfn5Q8BXA0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrfn5Q8BXA0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrfn5Q8BXA0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrfn5Q8BXA0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrfn5Q8BXA0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrfn5Q8BXA0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrfn5Q8BXA0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrfn5Q8BXA0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrfn5Q8BXA0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrfn5Q8BXA0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrfn5Q8BXA0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrfn5Q8BXA0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrfn5Q8BXA0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrfn5Q8BXA0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrfn5Q8BXA0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrfn5Q8BXA0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrfn5Q8BXA0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrfn5Q8BXA0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrfn5Q8BXA0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrfn5Q8BXA0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrfn5Q8BXA0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrfn5Q8BXA0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrfn5Q8BXA0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrfn5Q8BXA0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrfn5Q8BXA0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrfn5Q8BXA0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrfn5Q8BXA0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrfn5Q8BXA0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrfn5Q8BXA0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrfn5Q8BXA0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrfn5Q8BXA0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrfn5Q8BXA0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrfn5Q8BXA0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrfn5Q8BXA0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrfn5Q8BXA0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrfn5Q8BXA0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrfn5Q8BXA0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrfn5Q8BXA0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrfn5Q8BXA0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrfn5Q8BXA0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrfn5Q8BXA0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrfn5Q8BXA0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrfn5Q8BXA0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrfn5Q8BXA0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrfn5Q8BXA0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrfn5Q8BXA0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrfn5Q8BXA0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrfn5Q8BXA0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrfn5Q8BXA0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrfn5Q8BXA0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrfn5Q8BXA0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrfn5Q8BXA0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrfn5Q8BXA0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrfn5Q8BXA0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrfn5Q8BXA0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrfn5Q8BXA0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrfn5Q8BXA0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrfn5Q8BXA0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrfn5Q8BXA0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrfn5Q8BXA0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrfn5Q8BXA0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrfn5Q8BXA0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrfn5Q8BXA0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrfn5Q8BXA0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrfn5Q8BXA0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrfn5Q8BXA0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrfn5Q8BXA0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrfn5Q8BXA0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrfn5Q8BXA0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrfn5Q8BXA0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrfn5Q8BXA0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms