Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV16

Zfp398, Zinc finger protein 398, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp398Q8BV16 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zfp398Q8BV16 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zfp398Q8BV16 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zfp398Q8BV16 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zfp398Q8BV16 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zfp398Q8BV16 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Zfp398Q8BV16 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Zfp398Q8BV16 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zfp398Q8BV16 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zfp398Q8BV16 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zfp398Q8BV16 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zfp398Q8BV16 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zfp398Q8BV16 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zfp398Q8BV16 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zfp398Q8BV16 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zfp398Q8BV16 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zfp398Q8BV16 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zfp398Q8BV16 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zfp398Q8BV16 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zfp398Q8BV16 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zfp398Q8BV16 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zfp398Q8BV16 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zfp398Q8BV16 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zfp398Q8BV16 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zfp398Q8BV16 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zfp398Q8BV16 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zfp398Q8BV16 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zfp398Q8BV16 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zfp398Q8BV16 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zfp398Q8BV16 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zfp398Q8BV16 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zfp398Q8BV16 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zfp398Q8BV16 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zfp398Q8BV16 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zfp398Q8BV16 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Zfp398Q8BV16 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zfp398Q8BV16 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zfp398Q8BV16 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zfp398Q8BV16 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zfp398Q8BV16 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zfp398Q8BV16 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zfp398Q8BV16 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zfp398Q8BV16 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zfp398Q8BV16 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zfp398Q8BV16 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zfp398Q8BV16 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zfp398Q8BV16 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zfp398Q8BV16 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zfp398Q8BV16 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zfp398Q8BV16 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zfp398Q8BV16 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Zfp398Q8BV16 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zfp398Q8BV16 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zfp398Q8BV16 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zfp398Q8BV16 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zfp398Q8BV16 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zfp398Q8BV16 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zfp398Q8BV16 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zfp398Q8BV16 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zfp398Q8BV16 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Zfp398Q8BV16 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Zfp398Q8BV16 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zfp398Q8BV16 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zfp398Q8BV16 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zfp398Q8BV16 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zfp398Q8BV16 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zfp398Q8BV16 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zfp398Q8BV16 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zfp398Q8BV16 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zfp398Q8BV16 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zfp398Q8BV16 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zfp398Q8BV16 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zfp398Q8BV16 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Zfp398Q8BV16 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zfp398Q8BV16 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zfp398Q8BV16 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zfp398Q8BV16 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zfp398Q8BV16 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zfp398Q8BV16 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zfp398Q8BV16 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Zfp398Q8BV16 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zfp398Q8BV16 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zfp398Q8BV16 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zfp398Q8BV16 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Zfp398Q8BV16 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zfp398Q8BV16 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zfp398Q8BV16 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zfp398Q8BV16 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Zfp398Q8BV16 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zfp398Q8BV16 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zfp398Q8BV16 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zfp398Q8BV16 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zfp398Q8BV16 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zfp398Q8BV16 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zfp398Q8BV16 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zfp398Q8BV16 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zfp398Q8BV16 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zfp398Q8BV16 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zfp398Q8BV16 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zfp398Q8BV16 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms