Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQP8

Rab11fip4, Rab11 family-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip4Q8BQP8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rab11fip4Q8BQP8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rab11fip4Q8BQP8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rab11fip4Q8BQP8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rab11fip4Q8BQP8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rab11fip4Q8BQP8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rab11fip4Q8BQP8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Rab11fip4Q8BQP8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rab11fip4Q8BQP8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rab11fip4Q8BQP8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rab11fip4Q8BQP8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rab11fip4Q8BQP8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rab11fip4Q8BQP8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rab11fip4Q8BQP8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rab11fip4Q8BQP8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rab11fip4Q8BQP8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rab11fip4Q8BQP8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rab11fip4Q8BQP8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rab11fip4Q8BQP8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rab11fip4Q8BQP8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rab11fip4Q8BQP8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rab11fip4Q8BQP8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rab11fip4Q8BQP8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rab11fip4Q8BQP8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rab11fip4Q8BQP8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rab11fip4Q8BQP8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rab11fip4Q8BQP8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rab11fip4Q8BQP8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Rab11fip4Q8BQP8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rab11fip4Q8BQP8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rab11fip4Q8BQP8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rab11fip4Q8BQP8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rab11fip4Q8BQP8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rab11fip4Q8BQP8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rab11fip4Q8BQP8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rab11fip4Q8BQP8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Rab11fip4Q8BQP8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rab11fip4Q8BQP8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rab11fip4Q8BQP8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rab11fip4Q8BQP8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rab11fip4Q8BQP8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rab11fip4Q8BQP8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rab11fip4Q8BQP8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Rab11fip4Q8BQP8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rab11fip4Q8BQP8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rab11fip4Q8BQP8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rab11fip4Q8BQP8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rab11fip4Q8BQP8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rab11fip4Q8BQP8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rab11fip4Q8BQP8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rab11fip4Q8BQP8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rab11fip4Q8BQP8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Rab11fip4Q8BQP8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rab11fip4Q8BQP8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rab11fip4Q8BQP8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rab11fip4Q8BQP8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rab11fip4Q8BQP8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rab11fip4Q8BQP8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rab11fip4Q8BQP8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rab11fip4Q8BQP8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rab11fip4Q8BQP8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Rab11fip4Q8BQP8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rab11fip4Q8BQP8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rab11fip4Q8BQP8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rab11fip4Q8BQP8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rab11fip4Q8BQP8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rab11fip4Q8BQP8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rab11fip4Q8BQP8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rab11fip4Q8BQP8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Rab11fip4Q8BQP8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rab11fip4Q8BQP8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rab11fip4Q8BQP8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rab11fip4Q8BQP8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rab11fip4Q8BQP8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rab11fip4Q8BQP8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rab11fip4Q8BQP8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rab11fip4Q8BQP8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rab11fip4Q8BQP8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rab11fip4Q8BQP8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rab11fip4Q8BQP8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Rab11fip4Q8BQP8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rab11fip4Q8BQP8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rab11fip4Q8BQP8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rab11fip4Q8BQP8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rab11fip4Q8BQP8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rab11fip4Q8BQP8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rab11fip4Q8BQP8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rab11fip4Q8BQP8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rab11fip4Q8BQP8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rab11fip4Q8BQP8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rab11fip4Q8BQP8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rab11fip4Q8BQP8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rab11fip4Q8BQP8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rab11fip4Q8BQP8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Rab11fip4Q8BQP8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rab11fip4Q8BQP8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rab11fip4Q8BQP8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rab11fip4Q8BQP8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Rab11fip4Q8BQP8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Rab11fip4Q8BQP8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms