Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ73

Rspo4, R-spondin-4, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rspo4Q8BJ73 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,99■■□□□ 1,43
Rspo4Q8BJ73 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23,99■■□□□ 1,43
Rspo4Q8BJ73 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,98■■□□□ 1,43
Rspo4Q8BJ73 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,97■■□□□ 1,43
Rspo4Q8BJ73 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,97■■□□□ 1,43
Rspo4Q8BJ73 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23,96■■□□□ 1,43
Rspo4Q8BJ73 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23,96■■□□□ 1,43
Rspo4Q8BJ73 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,96■■□□□ 1,43
Rspo4Q8BJ73 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23,95■■□□□ 1,42
Rspo4Q8BJ73 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,95■■□□□ 1,42
Rspo4Q8BJ73 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23,94■■□□□ 1,42
Rspo4Q8BJ73 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23,94■■□□□ 1,42
Rspo4Q8BJ73 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23,93■■□□□ 1,42
Rspo4Q8BJ73 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,93■■□□□ 1,42
Rspo4Q8BJ73 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,93■■□□□ 1,42
Rspo4Q8BJ73 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,93■■□□□ 1,42
Rspo4Q8BJ73 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,91■■□□□ 1,42
Rspo4Q8BJ73 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23,9■■□□□ 1,42
Rspo4Q8BJ73 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23,89■■□□□ 1,42
Rspo4Q8BJ73 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23,89■■□□□ 1,41
Rspo4Q8BJ73 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23,89■■□□□ 1,41
Rspo4Q8BJ73 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,88■■□□□ 1,41
Rspo4Q8BJ73 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,87■■□□□ 1,41
Rspo4Q8BJ73 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23,86■■□□□ 1,41
Rspo4Q8BJ73 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23,85■■□□□ 1,41
Rspo4Q8BJ73 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23,84■■□□□ 1,41
Rspo4Q8BJ73 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23,84■■□□□ 1,41
Rspo4Q8BJ73 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23,84■■□□□ 1,41
Rspo4Q8BJ73 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,84■■□□□ 1,41
Rspo4Q8BJ73 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23,83■■□□□ 1,41
Rspo4Q8BJ73 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23,83■■□□□ 1,41
Rspo4Q8BJ73 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,83■■□□□ 1,41
Rspo4Q8BJ73 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,83■■□□□ 1,4
Rspo4Q8BJ73 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23,82■■□□□ 1,4
Rspo4Q8BJ73 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,82■■□□□ 1,4
Rspo4Q8BJ73 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23,82■■□□□ 1,4
Rspo4Q8BJ73 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,81■■□□□ 1,4
Rspo4Q8BJ73 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,81■■□□□ 1,4
Rspo4Q8BJ73 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,81■■□□□ 1,4
Rspo4Q8BJ73 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23,8■■□□□ 1,4
Rspo4Q8BJ73 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23,8■■□□□ 1,4
Rspo4Q8BJ73 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23,8■■□□□ 1,4
Rspo4Q8BJ73 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23,79■■□□□ 1,4
Rspo4Q8BJ73 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,79■■□□□ 1,4
Rspo4Q8BJ73 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23,79■■□□□ 1,4
Rspo4Q8BJ73 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,78■■□□□ 1,4
Rspo4Q8BJ73 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23,78■■□□□ 1,4
Rspo4Q8BJ73 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,76■■□□□ 1,39
Rspo4Q8BJ73 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,76■■□□□ 1,39
Rspo4Q8BJ73 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23,76■■□□□ 1,39
Rspo4Q8BJ73 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,76■■□□□ 1,39
Rspo4Q8BJ73 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23,76■■□□□ 1,39
Rspo4Q8BJ73 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,76■■□□□ 1,39
Rspo4Q8BJ73 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23,76■■□□□ 1,39
Rspo4Q8BJ73 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,75■■□□□ 1,39
Rspo4Q8BJ73 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,75■■□□□ 1,39
Rspo4Q8BJ73 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,75■■□□□ 1,39
Rspo4Q8BJ73 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,73■■□□□ 1,39
Rspo4Q8BJ73 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,73■■□□□ 1,39
Rspo4Q8BJ73 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23,73■■□□□ 1,39
Rspo4Q8BJ73 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,73■■□□□ 1,39
Rspo4Q8BJ73 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,73■■□□□ 1,39
Rspo4Q8BJ73 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23,72■■□□□ 1,39
Rspo4Q8BJ73 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,72■■□□□ 1,39
Rspo4Q8BJ73 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,71■■□□□ 1,39
Rspo4Q8BJ73 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23,71■■□□□ 1,39
Rspo4Q8BJ73 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,38
Rspo4Q8BJ73 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,38
Rspo4Q8BJ73 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,38
Rspo4Q8BJ73 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,38
Rspo4Q8BJ73 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23,7■■□□□ 1,38
Rspo4Q8BJ73 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,69■■□□□ 1,38
Rspo4Q8BJ73 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23,69■■□□□ 1,38
Rspo4Q8BJ73 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23,68■■□□□ 1,38
Rspo4Q8BJ73 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23,68■■□□□ 1,38
Rspo4Q8BJ73 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23,66■■□□□ 1,38
Rspo4Q8BJ73 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23,66■■□□□ 1,38
Rspo4Q8BJ73 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,65■■□□□ 1,38
Rspo4Q8BJ73 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23,65■■□□□ 1,38
Rspo4Q8BJ73 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
Rspo4Q8BJ73 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
Rspo4Q8BJ73 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
Rspo4Q8BJ73 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
Rspo4Q8BJ73 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
Rspo4Q8BJ73 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23,61■■□□□ 1,37
Rspo4Q8BJ73 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,61■■□□□ 1,37
Rspo4Q8BJ73 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
Rspo4Q8BJ73 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
Rspo4Q8BJ73 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
Rspo4Q8BJ73 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23,61■■□□□ 1,37
Rspo4Q8BJ73 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23,6■■□□□ 1,37
Rspo4Q8BJ73 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23,6■■□□□ 1,37
Rspo4Q8BJ73 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23,6■■□□□ 1,37
Rspo4Q8BJ73 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23,6■■□□□ 1,37
Rspo4Q8BJ73 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23,6■■□□□ 1,37
Rspo4Q8BJ73 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23,6■■□□□ 1,37
Rspo4Q8BJ73 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,59■■□□□ 1,37
Rspo4Q8BJ73 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,59■■□□□ 1,37
Rspo4Q8BJ73 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,59■■□□□ 1,37
Rspo4Q8BJ73 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,57■■□□□ 1,36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30,2 ms