Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rufy1Q8BIJ7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rufy1Q8BIJ7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rufy1Q8BIJ7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rufy1Q8BIJ7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rufy1Q8BIJ7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rufy1Q8BIJ7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rufy1Q8BIJ7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rufy1Q8BIJ7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rufy1Q8BIJ7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rufy1Q8BIJ7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rufy1Q8BIJ7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rufy1Q8BIJ7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rufy1Q8BIJ7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rufy1Q8BIJ7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rufy1Q8BIJ7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rufy1Q8BIJ7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rufy1Q8BIJ7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rufy1Q8BIJ7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rufy1Q8BIJ7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rufy1Q8BIJ7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rufy1Q8BIJ7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rufy1Q8BIJ7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rufy1Q8BIJ7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rufy1Q8BIJ7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Rufy1Q8BIJ7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rufy1Q8BIJ7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rufy1Q8BIJ7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rufy1Q8BIJ7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rufy1Q8BIJ7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rufy1Q8BIJ7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rufy1Q8BIJ7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rufy1Q8BIJ7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rufy1Q8BIJ7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rufy1Q8BIJ7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rufy1Q8BIJ7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rufy1Q8BIJ7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rufy1Q8BIJ7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rufy1Q8BIJ7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rufy1Q8BIJ7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rufy1Q8BIJ7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rufy1Q8BIJ7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rufy1Q8BIJ7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rufy1Q8BIJ7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rufy1Q8BIJ7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Rufy1Q8BIJ7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rufy1Q8BIJ7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rufy1Q8BIJ7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rufy1Q8BIJ7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rufy1Q8BIJ7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rufy1Q8BIJ7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Rufy1Q8BIJ7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rufy1Q8BIJ7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rufy1Q8BIJ7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rufy1Q8BIJ7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rufy1Q8BIJ7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rufy1Q8BIJ7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rufy1Q8BIJ7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rufy1Q8BIJ7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rufy1Q8BIJ7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Rufy1Q8BIJ7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rufy1Q8BIJ7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rufy1Q8BIJ7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rufy1Q8BIJ7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rufy1Q8BIJ7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rufy1Q8BIJ7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rufy1Q8BIJ7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rufy1Q8BIJ7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rufy1Q8BIJ7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rufy1Q8BIJ7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rufy1Q8BIJ7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rufy1Q8BIJ7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rufy1Q8BIJ7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rufy1Q8BIJ7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rufy1Q8BIJ7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rufy1Q8BIJ7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rufy1Q8BIJ7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rufy1Q8BIJ7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rufy1Q8BIJ7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rufy1Q8BIJ7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rufy1Q8BIJ7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rufy1Q8BIJ7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rufy1Q8BIJ7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rufy1Q8BIJ7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Rufy1Q8BIJ7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Rufy1Q8BIJ7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rufy1Q8BIJ7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rufy1Q8BIJ7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rufy1Q8BIJ7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rufy1Q8BIJ7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rufy1Q8BIJ7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rufy1Q8BIJ7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rufy1Q8BIJ7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rufy1Q8BIJ7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rufy1Q8BIJ7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rufy1Q8BIJ7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rufy1Q8BIJ7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rufy1Q8BIJ7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rufy1Q8BIJ7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rufy1Q8BIJ7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms