Protein–RNA interactions for Protein: Q8BI79

Ccdc40, Coiled-coil domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc40Q8BI79 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc40Q8BI79 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc40Q8BI79 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc40Q8BI79 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc40Q8BI79 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc40Q8BI79 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc40Q8BI79 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc40Q8BI79 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc40Q8BI79 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc40Q8BI79 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc40Q8BI79 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc40Q8BI79 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc40Q8BI79 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc40Q8BI79 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc40Q8BI79 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc40Q8BI79 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc40Q8BI79 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc40Q8BI79 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc40Q8BI79 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc40Q8BI79 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc40Q8BI79 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc40Q8BI79 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ccdc40Q8BI79 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ccdc40Q8BI79 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc40Q8BI79 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc40Q8BI79 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc40Q8BI79 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc40Q8BI79 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc40Q8BI79 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc40Q8BI79 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc40Q8BI79 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc40Q8BI79 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc40Q8BI79 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc40Q8BI79 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc40Q8BI79 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc40Q8BI79 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc40Q8BI79 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc40Q8BI79 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc40Q8BI79 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc40Q8BI79 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc40Q8BI79 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc40Q8BI79 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc40Q8BI79 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc40Q8BI79 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc40Q8BI79 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc40Q8BI79 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc40Q8BI79 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc40Q8BI79 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc40Q8BI79 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc40Q8BI79 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc40Q8BI79 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc40Q8BI79 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc40Q8BI79 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc40Q8BI79 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc40Q8BI79 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc40Q8BI79 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc40Q8BI79 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc40Q8BI79 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc40Q8BI79 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc40Q8BI79 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc40Q8BI79 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc40Q8BI79 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc40Q8BI79 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc40Q8BI79 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc40Q8BI79 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc40Q8BI79 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc40Q8BI79 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc40Q8BI79 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccdc40Q8BI79 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc40Q8BI79 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc40Q8BI79 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc40Q8BI79 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc40Q8BI79 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc40Q8BI79 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc40Q8BI79 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc40Q8BI79 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc40Q8BI79 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc40Q8BI79 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc40Q8BI79 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc40Q8BI79 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc40Q8BI79 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc40Q8BI79 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc40Q8BI79 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc40Q8BI79 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc40Q8BI79 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc40Q8BI79 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc40Q8BI79 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc40Q8BI79 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc40Q8BI79 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc40Q8BI79 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc40Q8BI79 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccdc40Q8BI79 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccdc40Q8BI79 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc40Q8BI79 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc40Q8BI79 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc40Q8BI79 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc40Q8BI79 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc40Q8BI79 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc40Q8BI79 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc40Q8BI79 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms