Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHF7

Pgs1, CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgs1Q8BHF7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pgs1Q8BHF7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pgs1Q8BHF7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pgs1Q8BHF7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pgs1Q8BHF7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pgs1Q8BHF7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pgs1Q8BHF7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pgs1Q8BHF7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pgs1Q8BHF7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pgs1Q8BHF7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pgs1Q8BHF7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pgs1Q8BHF7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pgs1Q8BHF7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pgs1Q8BHF7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pgs1Q8BHF7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pgs1Q8BHF7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pgs1Q8BHF7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pgs1Q8BHF7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pgs1Q8BHF7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pgs1Q8BHF7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pgs1Q8BHF7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pgs1Q8BHF7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pgs1Q8BHF7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Pgs1Q8BHF7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pgs1Q8BHF7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pgs1Q8BHF7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pgs1Q8BHF7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pgs1Q8BHF7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pgs1Q8BHF7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pgs1Q8BHF7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pgs1Q8BHF7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pgs1Q8BHF7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pgs1Q8BHF7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pgs1Q8BHF7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pgs1Q8BHF7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pgs1Q8BHF7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Pgs1Q8BHF7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pgs1Q8BHF7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pgs1Q8BHF7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pgs1Q8BHF7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pgs1Q8BHF7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pgs1Q8BHF7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pgs1Q8BHF7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pgs1Q8BHF7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pgs1Q8BHF7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pgs1Q8BHF7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pgs1Q8BHF7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pgs1Q8BHF7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pgs1Q8BHF7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pgs1Q8BHF7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pgs1Q8BHF7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pgs1Q8BHF7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pgs1Q8BHF7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pgs1Q8BHF7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pgs1Q8BHF7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pgs1Q8BHF7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pgs1Q8BHF7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pgs1Q8BHF7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pgs1Q8BHF7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pgs1Q8BHF7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pgs1Q8BHF7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pgs1Q8BHF7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pgs1Q8BHF7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pgs1Q8BHF7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pgs1Q8BHF7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pgs1Q8BHF7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pgs1Q8BHF7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pgs1Q8BHF7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pgs1Q8BHF7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pgs1Q8BHF7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pgs1Q8BHF7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pgs1Q8BHF7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pgs1Q8BHF7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pgs1Q8BHF7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pgs1Q8BHF7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pgs1Q8BHF7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pgs1Q8BHF7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pgs1Q8BHF7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Pgs1Q8BHF7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pgs1Q8BHF7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pgs1Q8BHF7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pgs1Q8BHF7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pgs1Q8BHF7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pgs1Q8BHF7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pgs1Q8BHF7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pgs1Q8BHF7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pgs1Q8BHF7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pgs1Q8BHF7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pgs1Q8BHF7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pgs1Q8BHF7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pgs1Q8BHF7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pgs1Q8BHF7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pgs1Q8BHF7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pgs1Q8BHF7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pgs1Q8BHF7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pgs1Q8BHF7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pgs1Q8BHF7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pgs1Q8BHF7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pgs1Q8BHF7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pgs1Q8BHF7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms