Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH04

Pck2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pck2Q8BH04 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pck2Q8BH04 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pck2Q8BH04 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pck2Q8BH04 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pck2Q8BH04 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pck2Q8BH04 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pck2Q8BH04 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pck2Q8BH04 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pck2Q8BH04 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pck2Q8BH04 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pck2Q8BH04 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pck2Q8BH04 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pck2Q8BH04 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pck2Q8BH04 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Pck2Q8BH04 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pck2Q8BH04 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pck2Q8BH04 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pck2Q8BH04 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pck2Q8BH04 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pck2Q8BH04 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pck2Q8BH04 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pck2Q8BH04 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pck2Q8BH04 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pck2Q8BH04 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pck2Q8BH04 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Pck2Q8BH04 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Pck2Q8BH04 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pck2Q8BH04 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pck2Q8BH04 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pck2Q8BH04 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pck2Q8BH04 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pck2Q8BH04 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pck2Q8BH04 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pck2Q8BH04 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Pck2Q8BH04 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pck2Q8BH04 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pck2Q8BH04 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pck2Q8BH04 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pck2Q8BH04 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pck2Q8BH04 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pck2Q8BH04 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pck2Q8BH04 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pck2Q8BH04 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pck2Q8BH04 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pck2Q8BH04 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pck2Q8BH04 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pck2Q8BH04 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pck2Q8BH04 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pck2Q8BH04 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Pck2Q8BH04 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pck2Q8BH04 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pck2Q8BH04 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pck2Q8BH04 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pck2Q8BH04 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pck2Q8BH04 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pck2Q8BH04 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pck2Q8BH04 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pck2Q8BH04 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pck2Q8BH04 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pck2Q8BH04 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Pck2Q8BH04 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pck2Q8BH04 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pck2Q8BH04 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pck2Q8BH04 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pck2Q8BH04 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Pck2Q8BH04 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pck2Q8BH04 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pck2Q8BH04 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pck2Q8BH04 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pck2Q8BH04 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pck2Q8BH04 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pck2Q8BH04 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pck2Q8BH04 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pck2Q8BH04 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pck2Q8BH04 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pck2Q8BH04 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pck2Q8BH04 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pck2Q8BH04 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pck2Q8BH04 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pck2Q8BH04 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pck2Q8BH04 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pck2Q8BH04 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Pck2Q8BH04 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pck2Q8BH04 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Pck2Q8BH04 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pck2Q8BH04 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pck2Q8BH04 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pck2Q8BH04 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pck2Q8BH04 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Pck2Q8BH04 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pck2Q8BH04 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pck2Q8BH04 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pck2Q8BH04 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pck2Q8BH04 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pck2Q8BH04 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pck2Q8BH04 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pck2Q8BH04 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pck2Q8BH04 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pck2Q8BH04 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pck2Q8BH04 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms