Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ubash3bQ8BGG7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ubash3bQ8BGG7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ubash3bQ8BGG7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ubash3bQ8BGG7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ubash3bQ8BGG7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ubash3bQ8BGG7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ubash3bQ8BGG7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ubash3bQ8BGG7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ubash3bQ8BGG7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubash3bQ8BGG7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubash3bQ8BGG7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubash3bQ8BGG7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubash3bQ8BGG7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ubash3bQ8BGG7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ubash3bQ8BGG7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ubash3bQ8BGG7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ubash3bQ8BGG7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ubash3bQ8BGG7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ubash3bQ8BGG7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ubash3bQ8BGG7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ubash3bQ8BGG7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ubash3bQ8BGG7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubash3bQ8BGG7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubash3bQ8BGG7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubash3bQ8BGG7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubash3bQ8BGG7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubash3bQ8BGG7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubash3bQ8BGG7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubash3bQ8BGG7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubash3bQ8BGG7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubash3bQ8BGG7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubash3bQ8BGG7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubash3bQ8BGG7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubash3bQ8BGG7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubash3bQ8BGG7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubash3bQ8BGG7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ubash3bQ8BGG7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ubash3bQ8BGG7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ubash3bQ8BGG7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ubash3bQ8BGG7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubash3bQ8BGG7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubash3bQ8BGG7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubash3bQ8BGG7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubash3bQ8BGG7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubash3bQ8BGG7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ubash3bQ8BGG7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ubash3bQ8BGG7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ubash3bQ8BGG7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ubash3bQ8BGG7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ubash3bQ8BGG7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ubash3bQ8BGG7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ubash3bQ8BGG7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ubash3bQ8BGG7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubash3bQ8BGG7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubash3bQ8BGG7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubash3bQ8BGG7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubash3bQ8BGG7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubash3bQ8BGG7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubash3bQ8BGG7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubash3bQ8BGG7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubash3bQ8BGG7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubash3bQ8BGG7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubash3bQ8BGG7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubash3bQ8BGG7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubash3bQ8BGG7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubash3bQ8BGG7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubash3bQ8BGG7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubash3bQ8BGG7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubash3bQ8BGG7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ubash3bQ8BGG7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ubash3bQ8BGG7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ubash3bQ8BGG7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ubash3bQ8BGG7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ubash3bQ8BGG7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubash3bQ8BGG7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubash3bQ8BGG7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubash3bQ8BGG7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubash3bQ8BGG7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubash3bQ8BGG7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubash3bQ8BGG7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubash3bQ8BGG7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubash3bQ8BGG7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ubash3bQ8BGG7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ubash3bQ8BGG7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ubash3bQ8BGG7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ubash3bQ8BGG7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ubash3bQ8BGG7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ubash3bQ8BGG7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ubash3bQ8BGG7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ubash3bQ8BGG7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ubash3bQ8BGG7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ubash3bQ8BGG7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ubash3bQ8BGG7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubash3bQ8BGG7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubash3bQ8BGG7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubash3bQ8BGG7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubash3bQ8BGG7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubash3bQ8BGG7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ubash3bQ8BGG7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms