Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZI6

Lrsam1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrsam1Q80ZI6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lrsam1Q80ZI6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lrsam1Q80ZI6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lrsam1Q80ZI6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lrsam1Q80ZI6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lrsam1Q80ZI6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lrsam1Q80ZI6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lrsam1Q80ZI6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lrsam1Q80ZI6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lrsam1Q80ZI6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lrsam1Q80ZI6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lrsam1Q80ZI6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lrsam1Q80ZI6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lrsam1Q80ZI6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lrsam1Q80ZI6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lrsam1Q80ZI6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Lrsam1Q80ZI6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lrsam1Q80ZI6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lrsam1Q80ZI6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lrsam1Q80ZI6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lrsam1Q80ZI6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lrsam1Q80ZI6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lrsam1Q80ZI6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lrsam1Q80ZI6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lrsam1Q80ZI6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lrsam1Q80ZI6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lrsam1Q80ZI6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lrsam1Q80ZI6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lrsam1Q80ZI6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lrsam1Q80ZI6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lrsam1Q80ZI6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lrsam1Q80ZI6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lrsam1Q80ZI6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lrsam1Q80ZI6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lrsam1Q80ZI6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lrsam1Q80ZI6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lrsam1Q80ZI6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lrsam1Q80ZI6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lrsam1Q80ZI6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lrsam1Q80ZI6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lrsam1Q80ZI6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lrsam1Q80ZI6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Lrsam1Q80ZI6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Lrsam1Q80ZI6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Lrsam1Q80ZI6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Lrsam1Q80ZI6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Lrsam1Q80ZI6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Lrsam1Q80ZI6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Lrsam1Q80ZI6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Lrsam1Q80ZI6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Lrsam1Q80ZI6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Lrsam1Q80ZI6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lrsam1Q80ZI6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lrsam1Q80ZI6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lrsam1Q80ZI6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lrsam1Q80ZI6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lrsam1Q80ZI6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lrsam1Q80ZI6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lrsam1Q80ZI6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lrsam1Q80ZI6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lrsam1Q80ZI6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lrsam1Q80ZI6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lrsam1Q80ZI6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lrsam1Q80ZI6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lrsam1Q80ZI6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Lrsam1Q80ZI6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lrsam1Q80ZI6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lrsam1Q80ZI6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lrsam1Q80ZI6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lrsam1Q80ZI6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lrsam1Q80ZI6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lrsam1Q80ZI6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lrsam1Q80ZI6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lrsam1Q80ZI6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lrsam1Q80ZI6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lrsam1Q80ZI6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lrsam1Q80ZI6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lrsam1Q80ZI6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lrsam1Q80ZI6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lrsam1Q80ZI6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lrsam1Q80ZI6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lrsam1Q80ZI6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Lrsam1Q80ZI6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lrsam1Q80ZI6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lrsam1Q80ZI6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lrsam1Q80ZI6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lrsam1Q80ZI6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lrsam1Q80ZI6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lrsam1Q80ZI6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lrsam1Q80ZI6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lrsam1Q80ZI6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lrsam1Q80ZI6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lrsam1Q80ZI6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lrsam1Q80ZI6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lrsam1Q80ZI6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lrsam1Q80ZI6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lrsam1Q80ZI6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lrsam1Q80ZI6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lrsam1Q80ZI6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Lrsam1Q80ZI6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms